（一）预缴方式。跨市总分机构企业应根据核定的应纳税额，分别由总机构、分支机构按月或按季就地预缴。预缴方式一经确定，当年度不得变更。
（二）就地预缴。由总机构根据企业本期累计实际经营结果统一计算企业实际利润额、应纳税额，并分别由总机构、分支机构分期预缴。
1．分支机构分摊的预缴税款。总机构在每月或每季终了之日起十日内，按照以前年度（1-6月份按上上年，7-12月份按上年）各市分支机构的经营收入、职工工资和资产总额三个因紊，将统一计算的企业当期应纳税额的75％在各分支机构之间进行分摊（总机构所在市同时设有分支机构的，同样按三个因素分摊），各分支机构根据分摊税款就地办理缴库，所缴纳税款收入中央分享6 0％、自治区分享1 O％、地方分享30％。分摊时三个因素权重依次为0．35、0．35和0．3。当年新设立的分支机构第二年起参与分摊；当年撤销的分支机构第二年起不参与分摊。
分支机构经营收入，是指企业在销售商品或者提供劳务等经营业务中实现的全部营业收入。其中，生产经营企业经营收入是指生产经营企业销售商品、提供劳务等取得的全部收入；金融企业经营收入是指金融企业取得的利息和手续费等全部收入；保险企业经营收入是指保险企业取得的保费等全部收入．
分支机构职工工资，是指企业为获得职工提供的服务而给予各种形式的报酬及其他相关支出。
分支机构资产总额，是指企业拥有或者控制的除无形资产外能以货币计量的经济资源总额。
各分支机构分摊预缴额按下列公式计算：
各分支机构分摊预缴额＝所有分支机构应分摊的预缴总额×该分支机构分摊比例
其中：
所有分支机构应分摊的预缴总额＝统一计算的企业当期应纳税额×75％
该分支机构分摊比例＝（该分支机构经营收入／各分支机构经营收入总额）×0．35＋（该分支机构职工工资／各分支机构职工工资总额）x 0．35＋（该分支机构资产总额／各分支机构资产总额之和）×0．30
以上公式中，分支机构仅指需要参与就地预缴的分支机构。
2．总机构就地预缴税款。总机构应将统一计算的企业当期应纳税额的25％，就地办理缴库．所缴纳税款收入中央分享60％、自治区分享1O％、地方分享30％。
四、预缴税款缴库程序
（一）分支机构分摊的预缴税款由分支机构办理就地缴库。分支机构所在地税务机关开具税收缴款书，预算科目栏按企业所有制性质对应填写。1010444项，“跨市县分支机构预缴所得税”下的有关目级科目名称及代码，“级次”栏填写“中央60％、自治区1O％、地方分享3O％”。
