（三）协调发展、均衡受益
在新型农村合作医疗统一制度、统一标准的基础上，进一步在区级层面统筹新型农村合作医疗基金管理，不断缩小城乡、区域、人群之间的医疗保障差距，推动新型农村合作医疗的均衡发展。在实现新型农村合作医疗工作的“三个统一”。统一制度，即浦东新区新型农村合作医疗制度实行全区统一；统一缴费标准；统一补偿比例。
（四）区级统筹、分级管理
建立区级统筹机制，提高新型农村合作医疗统筹层次，加大抗风险能力，确保资金安全。建立区镇（街道）两级政府分级管理、风险分担机制，明确管理职责，规范工作流程，科学使用基金，确保新型农村合作医疗的有序运行。
（五）规范运作、严格监控
进一步建立健全全区新型农村合作医疗制度，加强新型农村合作医疗规范管理和有效监管，严格预算管理，以支定筹，着力提高基金使用效率，保证新型农村合作医疗制度健康、持续、有效、安全运行。
三、健全组织体系，提高管理效能
（一）浦东新区新型农村合作医疗管理委员会（以下简称“区合管委会”）
区合管委会由区政府分管领导担任主任，卫生局、农委、人保局、财政局、发改委、税务局等有关部门为成员单位。下设经办机构浦东新区新型农村合作医疗管理办公室（以下简称“区合管办”）， 隶属于区卫生局，负责具体工作。区合管办为事业编制独立法人机构，与区初级卫生保健委员会办公室合署办公。
区合管委会职责：指导相关部门制订《浦东新区新型农村合作医疗制度实施意见》和《浦东新区新型农村合作医疗制度实施细则》；制订新区年度新型农村合作医疗基金预算，统筹协调新型农村合作医疗工作的实施；受区政府委托定期向新区人大汇报工作。
区合管办职责：负责组织实施《浦东新区新型农村合作医疗制度实施意见》和《浦东新区新型农村合作医疗制度实施细则》规定的相关任务；根据上年度新型农村合作医疗运行情况，提出下一年基金预算建议，经区合管委会审定后报市合作医疗事务中心审批；宣传发动、协调指导、检查督促全区合作医疗工作，总结经验，及时推广。
（二）各镇（街道）新型农村合作医疗管理委员会（以下简称“镇（街道）合管委会”）
各镇（街道）合管委会由镇长（街道主任）担任主任，分管领导任常务副主任，下设办公室（镇合作医疗事务所），为镇（街道）合作医疗经办机构，业务上接受区合管办指导，与镇（街道）初级卫生保健办公室合署办公。
