（一）市直管河段河道砂石资源费全额缴入市级金库，由市级统筹安排。
（二）委托区县（自治县）管理的“三江”河段河道砂石资源费全额缴入市级金库；市级将其中的70%用于安排所在区县（自治县）河道建设及管理。
（三）其他河道的河道砂石资源费按市级20%、区县（自治县）80%缴入同级金库。
第十条 市、区县（自治县）水行政主管部门征收的河道砂石资源费，按照重庆市财政局、人民银行重庆营业管理部《关于印发〈重庆市市级非税收入收缴管理试行办法〉的通知》（渝财综〔2003〕26号）规定，统一纳入非税收入收缴管理系统进行征管。其中：“三江”河道由市水行政主管部门开具非税收入一般缴款书，其他河道由各区县（自治县）水行政主管部门开具非税收入一般缴款书。各区县（自治县）财政局在非税收入缴库时按比例分别入库，列“103044601河道采砂管理费”收入科目。
第十一条 市、区县（自治县）级财政部门应当定期会同同级人民银行、水行政主管部门进行河道砂石资源费收入核查，确保市、区县（自治县）分成的河道砂石资源费收入及时全额缴入各级金库。
第四章 使用管理
第十二条 河道砂石资源费全额纳入各级财政预算管理，统筹用于水利建设与管理。市级分成的河道砂石资源费纳入市级财政预算管理，区县（自治县）分成的河道砂石资源费纳入区县（自治县）财政预算管理。主要用于下列河道建设与管理工作：
（一）维护河道安全，开展河道整治及清淤、清障工作；
（二）编制河道管理规划、制定河道建设管理技术标准，研究河道管理政策法规及开展宣传教育培训；
（三）开展河道砂石资源开采可行性论证、采砂行政许可及河道采砂日常监督管理工作；
（四）提高河道管理能力，建设河道管理基地、码头，配置管理器材、执法装备等；建设河道管理信息系统；
（五）河道采砂拍卖、招标、挂牌等工作经费；
（六）河道建设与管理的其它工作；
（七）其他水利建设项目与管理工作。
河道砂石资源费支出按“政府收支分类科目”列第213类“农林水事务”03款“水利”32项“砂石资源费支出”。
