（一）办公室（卫生法制科、机关党委办公室）。
组织综合性政策调研，拟订卫生工作重大政策；综合协调机关政务工作，负责全州直属单位的卫生目标管理，制定局机关各项工作制度；负责局综合性会议的组织及信息化建设；负责文秘、机要、档案、宣传、史志、年鉴、信访及机关保卫、计划生育、财务、固定资产管理、后勤保障等工作；负责新闻宣传、综合信息，卫生系统信息化建设、卫生统计工作的组织、实施及信息管理；负责重要工作督办，人大、政协议案、提案办理等工作。拟订地方卫生立法规划，组织协调地方卫生法规、规范性文件的起草、报批；负责卫生行政复议、行政诉讼和听证组织工作；负责卫生监督执法人员资格认证、证件发放和队伍管理；负责组织卫生执法检查并对执法工作实施监督；负责核准卫生许可和重大卫生行政处罚；负责卫生法制宣传、教育和法制建设。负责机关党委日常工作。
（二）基层卫生与妇幼保健科。
拟订全州初级卫生保健实施规划及农村、社区卫生服务的发展规划和服务标准，并实施监督；制定妇幼卫生和提高出生人口素质的发展规划、政策措施和技术规范，并实施监督；负责母婴保健法律、法规及有关专项技术服务的实施监督；负责妇幼保健机构标准化、规范化建设与管理和全州妇女儿童发展规划纲要卫生部分的组织实施；统筹协调健康教育工作。
（三）医政科（州献血办公室、干部保健科）。
拟订医疗机构的发展规划和管理办法；监督实施医疗机构的国家技术标准、医务人员职业道德和服务规范；办理规定范围内的医疗机构的审查批准手续，发放设置医疗机构批准书；办理规定范围内从业人员的资格认定及执业准入。监督管理全州医疗机构和医疗质量、服务质量；组织开展公民无偿献血和依法监督管理全州输血工作；负责血站的采供血及临床用血质量的管理；负责全州临床检验和临床药学管理工作；负责对医疗事故的行政处理；根据《
广告法》和《
医疗广告管理办法》的有关规定，加强医疗广告管理和监督，负责广告内容的审查、审批；协助有关部门规范医疗广告市场。制定干部医疗保健的实施办法，负责州干部保健委员会确定的保健对象的医疗保健工作；办理规定范围的“特约医疗证”等有关事宜；承办州干部保健委员会的日常工作。
（四）疾病预防控制科。
