（五）环境影响评价科（行政审批科）
贯彻执行规划、建设项目环境影响评价、环境保护“三同时”等法律、法规、规章和制度；负责规划和建设项目环境影响评价文件的审查审批；负责建设项目竣工环境保护验收；负责对环境影响评价资质证书持证单位进行日常监督；负责环境影响后评价工作；承办其他行政审批事项。
（六）自然生态保护科（农村环境保护科）
贯彻执行自然生态保护法律、法规和规章，拟订生态保护规划，组织评估生态环境质量状况，监督重要生态环境建设和生态破坏恢复工作；指导、协调、监督管理各种类型的自然保护区、风景名胜区、森林公园的环境保护工作；协调监督野生动植物保护、湿地环境保护、荒漠化防治工作；负责生物多样性保护、生物技术环境安全的监督管理工作；指导有机食品发展、生态示范创建与生态农业建设；承担生态州建设领导小组办公室的具体工作。贯彻执行农村和农业环境保护法律、法规、规章和政策；负责指导、协调、监督农村环境保护工作；组织编制并实施农村污染防治规划；组织协调农村和农业面源污染防治工作，监督管理农村集中式饮用水源保护区、小流域和湖库污染、村镇生活污染、养殖污染、土壤污染防治等工作；指导生态乡镇、生态村等农村生态建设示范区创建工作。
（七）核与辐射安全管理科（环境应急科）
组织实施核与辐射安全环境保护法律、法规、规章，拟订地方法规、标准和规范；负责核技术应用和输变电等电磁辐射装置及伴有放射性矿产资源建设项目环境影响评价文件审批、“三同时”监管；负责辐射安全许可管理，组织实施辐射安全监督检查；负责辐射环境监测；协助环境保护部、省环境保护厅开展辖区内核设施、放射性物品运输及铀矿监管；组织制订并实施全州核与辐射应急预案；负责核与辐射事故及投诉的调查处理，参与核与辐射恐怖事件的防范与处置工作。承担州突发环境事件应急指挥部办公室的具体工作；组织拟订我州重特大突发环境事件和生态破坏事件应急预案并监督实施；负责重特大突发环境事件应急、信息通报及应急预警；负责组织协调重特大突发环境事件和生态破坏事件应急处置及损失评估；负责环境来信来访；拟订和实施环境保护督查制度；负责环保系统挂牌督办和机关内部交办事项的督办工作。
四、人员编制和领导职数
阿坝州环境保护局机关行政编制16名。其中：局长1名、副局长2名；州纪委、州监察局派驻纪检组长1名；总工程师1名；机关党总支书记按州委规定配备；正科级领导职数8名（含监察室主任1名），副科级领导职数2名。
