农业标准化和农产品质量安全工程由自治县农业局、科技局牵头，会同自治县水产畜牧兽医局、林业局等部门组织实施。
节能减排科技示范工程，由自治县环保局、发改局、经贸局牵头，会同自治县科技局、建设局等部门组织实施。
新农村建设科技支撑行动，由自治县农业局牵头，会同自治县科技局、经贸局、建设局、林业局、扶贫办等部门组织实施。
科学技术普及拓展行动，由自治县科协、科技局牵头，会同县委宣传部、自治县经贸局、农业局、水产畜牧兽医局、林业局等部门组织实施。
为加强各部门的集成联动，部分科技项目可采取联合筛选、联合下文、联合组织实施、联合验收的办法。
五、主要措施
（一）加强领导，推动创新。加强对创新计划工作的领导，成立自治县创新计划2008－2010年实施工作领导小组，审议、评估、策划、协调创新计划重大事宜，定期商议创新计划重大事项。各乡（镇）人民政府要建立相应的机构，政府一把手为第一责任人，把组织实施创新计划作为重要任务，纳入政府重要议事日程，制定实施方案，层层量化分解工作任务，建立实施创新计划的责任制度，定期研究解决创新计划实施中的重大问题。
（二）集成联动，合力创新。加强工作集成，加强部门联动，搞好分工合作，盘活全社会的科技资源，形成推进科技创新的合力。项目遴选要注意横向、纵向的结合，在充分征集了解部门、地方重大科技需求的基础上，统筹考虑全县产品创新、技术进步和科技发展的需要，广泛咨询和听取专家意见，按照轻重缓急确定重大项目和重点项目，充分发挥各部门、各社会团体的积极性，统一组织，整合资源，大力协同，共同推进创新计划的实施。
（三）突出主体，引领创新。突出企业的技术创新主体地位。要坚持把建立技术创新机制、提高技术创新能力作为建设现代企业制度的重要措施。通过市场和政府的资源配置，推动企业成为技术创新和科技投入的主体。要更加注重引导和支持中小企业的技术创新，在政策、资金、服务和环境等方面采取更有力的措施，为科技型中小企业的成长壮大提供沃土。
突出人才在科技创新中的关键作用，大力实施人才战略，依托重大科研和建设项目、重点学科和科研基地建设项目，加强“人才小高地”建设，培养造就和引进一批科技领军人才，积极推动创新团队建设。
突出科技中介机构在科技创新中的服务作用。现有科技中介服务机构，要强化服务意识，增强服务能力，拓展服务领域，加强合作与互动，提高服务质量。通过政府引导和市场驱动，大力发展民营科技中介服务机构。
（四）加大投入，保障创新。发挥公共财政的杠杆功能，通过拨款、贴息等措施，进一步加大财政资金投入。强化财政科技投入导向，重点加强对产业共性关键技术开发、重大科技工程和重大技术引进消化吸收再创新等方面的资金支持。建立多元化、多渠道、高效率的科技投入体系，引导企业成为技术创新投入主体，鼓励金融机构加强对企业技术创新的信贷服务，加快建立科技型中小企业信用担保体系，大力发展科技风险投资机构，推动企业积极利用股份制融资等多种手段筹集发展资金，扩大和吸引社会资金的投入。
