第三阶段，检查复核阶段（2011年12月22日-2012年2月19日），省交通运输厅、发展改革委、财政厅、监察厅、省政府纠风办将对调查摸底、自查自纠及整改措施落实等有关工作进行督导和检查，必要时组织互查。对清理工作不到位或存在弄虚作假、敷衍塞责等行为的地方和单位，将通报批评，并责令其整改；情节严重的，依法依纪追究相关人员责任。
第四阶段，总结完善阶段（2012年2月20日-5月21日），有关省辖市政府和省交通运输厅高速公路管理局要认真总结专项清理工作情况，并于2012年3月底前将工作总结等有关情况报送省交通运输厅、发展改革委、财政厅、监察厅和省政府纠风办。省交通运输厅会同有关部门全面总结专项清理工作情况并上报省政府。有关部门要按照职责分工研究提出规范收费公路发展的长效措施，进一步完善收费公路通行费标准形成机制，科学确定经营性公路合理回报率，建立健全政府还贷收支情况定期审计制度、收费公路统计制度和监测制度，制定收费公路信息公开办法，强化收费公路服务质量监管力度，完善收费公路相关政策，通过采取完善制度、理顺体制、优化机制、强化监管措施，从根本上确保收费公路规范管理。
五、成立组织
省政府成立河南省收费公路专项清理工作领导小组。
领导小组成员名单如下：
组长：张大卫（副省长）
副组长：胡五岳（省人民政府副秘书长）
孙廷喜（省交通运输厅厅长）
成员：王红（省发展改革委副主任）
张中亮（省财政厅副厅长）
刘文来（省监察厅副厅长）
翟迎波（省政府纠风办副主任）
李和平（省交通运输厅副厅长）
领导小组下设办公室，李和平同志兼任办公室主任。
办公室工作人员名单如下：
李建生（省发展改革委价格收费处副处长）
海国正（省财政厅综合处调研员）
王巍（省监察厅副主任科员）
魏金立（省交通运输厅路政处处长）
张宏（省交通运输厅法规处处长）
柴中畅（省交通运输厅规划处处长）
徐芳（省交通运输厅财务处处长）
马远（省交通运输厅人事劳动处处长）
刘闯（省交通运输厅建设管理处处长）
