宽度≦50m的河道，设置河心1个采样站点；
宽度＞50m的河道，设置河心一个采样站点，增加离岸20m采样站点1个。
水深≦2m的河道，取水下0.5m处1个监测站点；
水深＞2m的河道，采集水下0.5m水层和离水底0.5m水层混合取样。
2011年河道生态治理试点工程监测站点设置
| 序号 | 所在区县 | 试点工程 | 建设长度（km） | 监测站点数 |
| 一 | 中心城区及郊区城镇化地区 | |
| | 徐汇 | 东上澳塘 | 1.73 | 3 |
| | 青浦 | 李腰泾 | 0.87 | 3 |
| 二 | 新城新镇及大型居住区 | |
| | 闵行 | 丰收河及支河 | 3.48 | 4 |
| | 奉贤 | 钱中河 | 2.1 | 3 |
| | 松江 | 任其浜（含湖泊） | 3 | 4 |
| 三 | 农村地区 | |
| | 金山 | 斜泾港 | 3.06 | 3 |
| | 崇明 | 万平河 | 3.95 | 4 |
| | 合计 | | 18.2 | 24 |
五、试点河道监测方案
