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负责交通基础设施建设市场的监督管理；承担交通建设工程质量、造价监督、安全生产监督、工程定额管理工作；承担市管交通建设项目设计、施工许可审查审批和省管交通建设项目施工许可审批初审工作；负责市管交通建设项目的竣（交）工验收工作；协助做好固定资产投资统计工作；指导公路养护和农村公路建设、管理工作。
（五）安全法规科（应急办公室）。
参与交通运输行业规范性文件的合法性审核工作；承办执法听证、行政复议和行政应诉工作；指导本系统依法行政和普法教育工作；制定并组织实施全市交通运输行业安全生产管理工作规划、计划；指导全市交通运输行业生产的管理工作，监督落实安全生产责任制，指导交通行业安全生产和应急管理的宣传教育工作；监督指导局机关及直属单位的内部安全保卫工作；按规定组织或参与交通行业安全生产事故的调查处理工作；负责全市渡口、渡船更新改造、安保工程计划的编制并组织实施；负责对交通运输行业安全生产情况统计上报工作。
（六）财务审计科。
贯彻执行国家各项财经政策和交通运输行业的财务会计规章制度；负责制订本系统财务、审计规章制度和交通资金使用管理制度、办法；协调或参与交通建设资金的筹措，会同有关部门拟订交通运输有关规费政策并监督实施；负责管理各项交通建设专用资金的财务工作，并对资金使用情况进行检查和审计监督；负责对本局及直属单位固定资产的监管和财务审计工作；负责局机关财务工作。
（七）公共交通管理科。
负责全市公共汽车、出租汽车、轨道交通、铁路的管理；承担协调地方铁路之间和地方铁路与国家铁路交接站或换装站接轨事宜；拟订地方铁路建设投融资办法；负责全市公共交通运输市场的监督管理；负责公共交通线网布局的具体实施；负责起草公共交通行业营运服务标准并组织实施；负责审批本市公共交通营运线路和站点的设置与调整；负责公共交通经营许可以及运力投放的审批；负责公共交通车辆更新的核准工作；负责城乡公交统筹规划、城乡公交一体化政策拟定和实施；负责承担政府指令性公共交通运输保障工作；协调中央垂直管理的海事、民航、邮政等管理机构的涉地相关工作。
（八）交通战备办公室。
负责全市国防交通战备工作；拟订本地区国防交通保障计划，组织国防交通保障队伍，为本地区内的军事行动和其他紧急任务组织交通保障；负责系统内民兵工作；负责国防交通战备的组织、协调管理，参与国防交通保障设施规划建设工作。
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