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（一）办公室
协助局领导处理日常工作、组织人事工作，协调机关政务工作；负责起草局综合性材料、重要报告和文件；承办局综合性会议、文秘、信息、宣传、信访、档案、保密、保卫、督查督办等工作；制定局机关有关规章制度并组织实施；负责本系统的安全生产工作；指导本行业法制宣传教育和法规咨询；负责局机关财务工作，管理局机关各项资金、资产；负责本行业有关统计工作，定期分析本行业经济运行情况并提出对策；承办局党、群、工、青、妇、计生和机关后勤服务等综合性工作。
（二）防疫检疫监督科（市重大动物疫病防治指挥部办公室）
负责拟订动物疫病防治、动物及动物产品检验检疫工作规划、年度计划和管理办法、技术规范，并组织实施；负责拟订突发重大动物疫情应急预案、方案并组织实施，协助组织实施突发重大动物疫情的应急处置工作；负责动物疫情的管理、监督、调查和预报预警；负责管理和指导兽医实验室动物疫病诊断、动物产品致病性微生物检测工作；负责无规定动物疫病区建设、管理和认证；负责动物及动物产品检验检疫的管理工作；负责动物及动物产品的防疫监督、动物产品的质量安全监管工作；组织协调相关部门做好重大动物疫病防控和督查工作；管理和指导局属动物疫病预防控制机构、动物卫生监督机构的业务工作；承担市人民政府重大动物疫病防治指挥部办公室的日常工作。
（三）兽医与药政科
负责拟订官方兽医、民间兽医的发展规划，负责拟订本行业行业规范、制度，并监督实施；负责动物诊疗机构的管理，核发动物诊疗许可证；负责各类兽医实验室的生物安全管理，实验动物、兽医微生物菌毒种管理；负责兽药生产、经营的监督管理工作，核发兽药经营许可证；拟定动物及动物产品兽药残留监控计划，并组织实施；负责官方兽医、民间兽医从业人员的培训、资格认定和管理；指导兽医、兽药行业社团专业技术工作和兽药专业人员技术培训工作。
（四）畜牧与饲料科（市饲料工业办公室）
负责拟订畜牧（含蜂、蚕）业、草业和饲料工业产品质量、安全、发展规划与年度计划，并组织实施；指导畜牧业养殖方式转变，指导种畜禽产品产地认证工作；负责畜禽遗传资源、牧草资源和饲料资源的保护与管理；组织畜牧业标准化和种畜禽、牧草、饲料标准和规范的推广实施工作，负责种畜禽质量监督；审核发放种畜禽生产经营许可证；制定畜禽养殖场、养殖小区的养殖方案并组织实施；负责草地监督管理、资源保护和生态治理，草地建设、利用和保护；管理下属畜牧管理站业务工作；指导畜牧行业社团的专业技术工作；负责畜牧行业人员专业技术培训工作。
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