乡镇卫生院（含一级医院）的单次门诊费用补偿比例可以定在25%左右，村卫生室单次门诊费用补偿比例可以定在30%左右；乡镇卫生院（含一级医院）单次门诊补偿封顶额可以定在8-10元，村卫生室单次门诊补偿封顶额可以定在6-8元（纯中药门诊处方的补偿封顶额可以提高1元）。原则上参合农民的年门诊补偿次数，一般户均不宜超过10次。
县级医院是否作为门诊统筹定点医院，由县级卫生行政部门决定。如果作为门诊定点医院，建议其单次门诊费用补偿比例不超过20%，封顶额不超过20元。在县外以及县内非定点医疗机构就诊的门诊费用一般不予补偿。
慢性病门诊的补偿比例和封顶线按各县（市、区）《新型农村合作医疗实施方案》执行。
五、门诊费用补偿范围
1、《甘肃省新型农村合作医疗药品目录（2008年版）》内的药品费用。
2、注射费、清创缝合及外科换药费、针灸及拔火罐费用等常规治疗费用。
3、X线、心电图、B超、化验等常规检查费用（仅限于县乡两级医疗机构）。各地应对上述三项费用作进一步明细规定。
六、门诊定点资格和医疗规范的管理
1、门诊统筹定点资格的管理。采取医疗机构自愿申报、县级新农合管理经办机构考核评估、县级卫生行政部门审批发证的办法，确定医疗机构的门诊统筹定点资格。由县级合作医疗管理经办机构与定点医疗机构签订门诊服务协议。
2、门诊医疗规范的管理。门诊定点医疗机构须使用县（市、区）卫生行政部门统一制作的门诊登记本、门诊补偿登记表、合作医疗门诊专用双联处方和专用三联收据（或发票）。得到补偿的门诊患者在门诊补偿登记表或专用处方上签名，并留下住址和联系电话号码。
七、门诊费用控制与支付方式
1、控制各级定点医疗机构的次均门诊费用。各地通过基线调查，了解当地门诊定点医疗机构的次均门诊费用水平，并提出上限控制标准。（目前，全省县、乡、村三级医疗机构的次均门诊医药费用一般水平为：县级医院40-60元，乡镇卫生院20-30元，村卫生室10-20元，各地制定实施方案时可参考。）
2、核定各定点医疗机构的门诊人次。对各医疗机构门诊人次进行基线调查和测算，合理确定年门诊人次上限标准。以基线调查数据为对照，严格控制各定点医疗机构的门诊人次年增长幅度（建议不超过5%）。
