各级人民政府：把传染病预防控制工作纳入政府工作日程，实行一把手负责制， 建立健全由政府牵头，卫生、财政、公安、教育、畜牧、药监、宣传等部门参加的传染病综合防治体系和部门联席会议制度，建立并完善长效防控机制，调动社会相关资源，落实各项传染病预防控制工作措施。
卫生部门：负责制定传染病防治技术方案，组织实施应急医疗救治和各项预防控制措施，并进行检查、督导；依法开展卫生执法监督管理，加强卫生技术培训；根据传染病预防控制工作需要，依法提出隔离、封锁有关地区等重大措施和建议；组织开展爱国卫生运动。
财政部门：保障传染病防治所需经费。
教育部门：组织实施学校传染病预防控制措施，防止传染病在校内发生和流行，做好在校学生、教职工的健康宣传教育和自我防护工作。
公安部门：协助市卫生局落实强制隔离、封锁疫点、疫区及人员的措施，做好艾滋病、狂犬病等防治工作。
畜牧部门：组织开展人畜共患传染病的监测和管理工作，组织专家分析和提出人畜共患动物疫病的预警信息。
林业部门：组织开展野生动物相关传染病的监测和管理工作，组织专家分析和提出有关野生动物活动范围和趋势等预警信息。
出入境检验检疫部门：组织出入境卫生检疫、传染病监测、卫生监督和卫生处置工作，及时收集和提供国外传染病疫情信息。
食品药品监管部门：负责突发公共卫生事件应急处置所需药品、诊断试剂、医疗器械等质量监督，配合卫生部门做好相关传染病防治工作。
民政部门：负责按政策对城乡低保对象进行医疗救助，协调做好死亡人员的火化和其他善后等工作。
宣传部门：组织广播影视、新闻出版单位，加强对卫生法律法规及传染病防治宣传，积极主动地对重大传染病疫情处置进行正确的舆论引导。
其他部门：在政府的统一领导下，加强协作，密切配合有关部门落实传染病预防控制工作。
四、防控措施
（一）加强传染病疫情监测和网络直报。各级卫生行政部门要认真抓好传染病疫情监测和报告工作，不定期检查各级医疗卫生单位网络直报系统的运作情况，建立健全各项疫情报告制度，保证疫情报告质量。要加强医疗机构传染病管理，加强疫情监测，完善市、县、乡、村四级传染病与突发公共卫生事件监测与信息报告体系，落实乡镇以上医疗机构传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报和村卫生室电话报告制度，县级以上医疗机构和乡镇卫生院网络直报开通率要达100%，月报告率要达100%。切实做好传染病预测预警预报，各级畜牧、林业部门和动物防疫机构要加强动物间疫情监测，建立疫情通报制度，科学预测预报人畜共患传染病疫情。
