各地科技主管部门归口管理本地区的专业镇建设工作，负责组织本地区的市级专业镇认定，并向省科技厅推荐省级专业镇候选名单，负责省级专业镇的立项初审，实施日常管理等工作。
专业镇镇政府负责制定规划、组织实施。
省科技主管部门负责建立省专业镇专家工作组，负责省级专业镇评审，指导专业镇制定规划，指导专业镇技术创新有关工作。
第六条 申请程序。专业镇认定是以“自愿申请、专家论证、择优遴选”为原则，由申请镇政府在网上填写《广东省技术创新专业镇认定申报书》并提交（www.gdstc.gov.cn），并同时在网上提交以下附件：①上年度镇的经济社会发展情况介绍；②上年度科技工作总结；③专业镇技术创新规划方案，除了在网上填写申报材料并提交外，将申报书及附件的纸质材料一式3份，由市（县）科技主管部门签署意见后报省科技主管部门。
第七条 申请条件：
⒈领导重视。镇（区）领导班子对技术创新有统一认识，具有改革、开拓精神，把技术创新工作纳入到镇经济社会发展规划中，并作为镇的重要工作来抓。
⒉基础条件。具有明显的产业发展特色，对技术创新有迫切的需求。工业领域和第三产业的专业镇，全镇工农业总产值达20亿元以上，其中特色产业产值占30%以上；农业领域的专业镇，全镇工农业总产值达10亿元以上，其中特色产业产值占30%以上。东西两翼和北部山区的特色产业镇申请条件可适当放宽。
⒊目标明确。申请专业镇的镇应有长远的经济发展规划和技术创新工作实施方案。
⒋已获得市级科技主管部门认定的市级专业镇资格。
第八条 审批程序。省科技主管部门根据申请，每年在6月30日前按照珠三角、粤东、粤西、粤北四个片区分别组织一次专家集中评审。由省科技厅和专家组根据每个镇的申报材料、评审汇报情况以及考察情况，共同对申请镇的申请条件及实施试点的基础进行考察和审定，将符合条件的专业镇认定“广东省技术创新专业镇”称号。
第九条 合同管理。省科技主管部门批准立项的“广东省技术创新专业镇”，由省科技主管部门（甲方）与镇政府（乙方）、市（县）科技主管部门（丙方）签订专业镇建设项目合同，明确各方的权利义务，各方应严格按合同规定行使权利和履行义务。对合同执行过程中出现的问题，各方应共同协商，妥善解决。
