4、医药经济趋向股份化、规模化、区域化发展。一批医药工商企业按照现代企业制度要求，初步建立起适应市场经济要求的经营机制框架，有效地促进生产经营发展。一批医药重点工商企业通过整合重组已成为支撑全省医药工业发展的重要力量，推动全省医药产业集中度逐步提高，如国有上市公司“南京医药”控股“同春药业”，上市公司“海王生物”并购“福药制药”，上市公司“丽珠医药”并购“福兴医药”，“片仔癀药业”并购漳州医药公司等。福州市江阴工业集中区和厦门海沧新阳工业区开始集聚一些医药企业和投资项目， 三明荆东生物医药园、泉州永春生物医药园、柘荣药城等处于规划或起始实施阶段。2005年全省医药股份制工业企业完成现价产值34.53亿元，占全省49.36％；大中型工业企业完成现价产值42.75亿元，占全省61.10％；福州厦门地区完成工业产值55.82亿元、利税5.8亿元分别占全省的64.06％、61.22% 。
5、中药材种植趋向基地化、规范化、规模化发展。初步形成闽西北山区的南方红豆杉、三尖杉、建泽泻、建莲子、泰宁雷公藤、绞股蓝、鱼腥草、鹿茸；闽东南山区和沿海的绿衣枳实、柘荣太子参、南玉桂、枇杷叶、茵陈、巴戟天、春砂仁、黄花蒿、熊胆、短葶山麦冬、青黛等16种中药材生产种植基地。其中建瓯建泽泻和柘荣太子参分别通过国家GAP认证，实现了我省中药材GAP认证零的突破。建立了全国最大的南方红豆杉和太子参种植基地。
（三） 存在的主要问题
我省医药经济总量在全国仍处于相对落后水平，当前制约医药经济进一步提升的主要问题：
1、企业规模小、实力弱。我省制药企业规模小，产品品种少，技术装备落后，无论是专业化程度、管理水平、生产集中度和经济效益都偏低。直至2005年，我省中型医药生产企业15家，占全省医药工业企业总数的17.6%，其余均为小型企业。
2、生产设备能力过剩。由于我国对制药企业实行GMP达标验证的生产许可证制度，制药企业为了GMP达标验证，投入大量资金进行技改，生产硬件设施得到改善，生产能力大幅提高，至使医药制剂闲置生产能力高达50%以上。从我省医药工业企业产能比显示，西药制剂产品和中成药生产能力严重过剩，详见下表。
2005年我省医药工业企业产能比情况表
| 序号 | 门类 | 产能比% | 序号 | 门类 | 产能比% |
| 1 | 原料药 | 88 | 5 | 输液 | 49.7 |
| 2 | 粉针剂 | 39.33 | 6 | 胶囊 | 9.33 |
| 3 | 注射剂 | 51.8 | 7 | 中成剂 | 30.15 |
| 4 | 片剂 | 41.92 | | | |
3、科技创新能力不足。医药行业属高技术产业，具有高技术、高投入、高附加值和高风险性的特点。由于新药研究开发技术难度大，研发周期长以及严格的临床试验要求，使整个研发费用高。国外医药企业每年新药研究开发投入占销售额的10%，发达国家达15～20%，而我省制药企业每年新药研究开发投入占企业销售额的比例远远低于国外企业。而且我省医药技术创新和科技成果转化的机制尚未完全形成，大多数医药企业不具备独立开发新药和消化科技成果的能力。因此，限制了我省新药开发，致使我省缺少具有自主知识产权的新产品，产品更新慢，低水平重复严重。我省医药行业老产品多，新产品、新剂型少；低档次与低附加值产品多，高新技术含量与高附加值产品少。应用高新技术改造传统产业的步伐较慢，技术经济指标不高，成本高，缺乏竞争实力。全省研制生产的一类新药品种仅2个，其它品种均为仿制品。
我省医药技术力量分散，专业人才总量偏少， 未能形成完整的新药研发体系。全省从事药品研发的机构，分属于不同的部门和企业，既有教育系统、科技系统、卫生系统，也有地方和企业所属的研发机构，条块分割，科技装备与人才资源急需整合优化。
4、产业结构有待优化。研发环节：基础研究薄弱，科研成果转化率低，无GLP试验室，中试孵化环节基本缺失。生产环节：化学原料药主要集中在抗生素发酵品种，化学合成药品种少、规模小；化学制剂主要集中在老剂型，并且品种严重重复；除小数品种外，中药材种植养殖规模偏小，中药材加工提取水平低，中药质量标准与质量控制体系有待完善；生物制药产业化规模小。
5、产业集聚度较低。一是企业在空间布局上较为分散，缺乏专业分工协作，缺少公共服务平台，还存在重复建设，必须加快产业集聚培育产业集群；二是作为产业集聚重要载体的医药产业园区建设缓慢，目前福州市江阴工业集中区和厦门海沧新阳工业区仅初具规模以及三明荆东和泉州永春生物医药产业园启动筹建，但福州江阴工业集中区只有福建省福抗药业股份有限公司和丽珠集团福兴医药有限公司2家，海沧新阳工业区聚集星鲨建发制药、迈克制药、特宝制药、英科新创等几家制药企业，企业之间关联度差、产品链短，没有国内外大型医药企业入园，没有科研院校研发平台入驻，没有形成集研究开发、企业孵化、生产制造、物流配送为一体的现代化医药产业园区。而且园区的基础、物流、环保、交通运输、信息通讯等设施有待完善。
6、产业发展资金严重缺乏。医药产业融资渠道窄，还没有健全的、符合市场规律的融资体系来支撑医药产业的发展，特别是对于技术成分高、风险大的项目缺乏支持。企业医药开发的投入相对不足，难以形成企业核心竞争力。
7、医药卫生体制改革尚未健全。目前基本医疗保险制度改革、医疗体制改革和医药流通体制改革尚未形成可操作的协调与持续发展机制。同时，药品集中招标采购、药品定价管理、药品质量监督管理机制有待进一步完善。药品营销能力低、物流成本高和购销行为不规范、无序竞争导致全省医药流通企业经营效益下降。
