考核采取综合评分方式进行，办公室每年应制定《耕地保护责任目标综合考核评分表》，对综合评分在90分以上（含90分）同时不具备前款四项否定性要求的，考核认定为“合格”；否则，考核认定为“不合格”。
在考核认定为“合格”的县（区）中，办公室可按一定比例综合评比出优秀县（区）。
九、考核方式
考核采取自查、抽查与核查相结合的方法。
（一）自查。各县（区）人民政府要按照本办法的规定，每年组织自查，并于11月向领导小组报告耕地保护责任目标的履行情况。
（二）抽查。办公室对各县（区）耕地保护责任目标履行情况进行不定期抽查，作出预警分析，并向领导小组报告。
（三）核查。办公室于当年12月底以前对各县（区）耕地保护责任目标履行情况进行考核，并向领导小组报告。
十、考核参考数据
全市土地利用变更调查提供的各县（区）耕地面积、生态退耕面积、基本农田面积、实际新增建设用地面积、违法占用耕地面积占新增建设用地占用耕地总面积的比例、分等定级的数据，将作为考核参照依据。
办公室采用抽样和国家卫星遥感监测等方法和手段，建立抽样调查制度和监测网络，对耕地、基本农田的面积和等级情况进行核查。
十一、基本农田档案
各县（区）人民政府要将基本农田落实到地块和农户，建立基本农田权属档案。
十二、考核报送时间
各县（区）人民政府要按照国家和自治区统一的规范，加强对耕地及基本农田的动态监测，在考核当年11月15日前向办公室提交耕地、基本农田的面积和等级情况的监测调查资料，并对数据的真实性负责。
十三、考核结果公布
耕地保护责任目标结果作为县（区）人民政府第一责任人工作业绩考核的内容，由市人民政府在全市范围内通报。
十四、考核奖励
经考核优秀的县（区）、乡（镇），由领导小组报市人民政府批准后，给予表扬和奖励。
对考核为“优秀”的县（区），市人民政府在安排中央、自治区和市本级支配的新增建设用地土地有偿使用费时可予以倾斜。
