一是上游来水污染。汾河在进入我市之前，已经污染十分严重，属于劣五类水质（据监测，汾河新绛站里断面的主要污染物COD年平均值为72.0mg/L）。同时，汾河常年径流很小，几乎没有自净能力。汾河运城段最大的一条支流浍河，其水质污染状况也相当严重。
二是城市生活污水的污染。汾河干线沿线的新绛、稷山、河津、万荣四县（市），城市污水年排水量约为1400万吨，占我市总排入汾河水量的54%左右。目前除新绛县日处理能力为7000吨的城市生活污水处理厂已经建成投运外（目前实际处理水量只有3000吨/日），其他三县（市）的生活污水处理厂都还处在建设阶段。城市污水未经处理直接排入汾河，加剧了汾河的污染。
三是工业企业污染。我市汾河流域的重点排污企业主要有山西新绛纺织有限公司、新绛汾河纸业有限公司、山西丰喜纯碱有限公司、山西合盛工贸有限公司、山西志峰农科贸有限公司、山西鸿昌农工贸有限公司等，年排污水量约为1200万吨，占我市总排入汾河水量的46%左右。虽然经过大力治理，大多数企业的生产废水已实现达标排放，但由于工业企业污水排放标准与河流（地表水）水质标准相差较大，仍然造成了河流水质的恶化。
四是河道底泥污染严重。由于长年累月的河流污染物积累，除洪水期外，基本没有冲刷能力，目前汾河主干运城段以及支流浍河运城段河道淤积严重，基本属于污泥。河道底泥对河流水质的污染加重了汾河水质污染的程度。
（三）水土流失严重，植被覆盖率低
运城市汾河流域总面积2493k㎡，其中水土流失面积1246.4k㎡，占总面积的50%。多年来平均侵蚀模数为4359t/k㎡，沟壑密度为1.06km/k㎡。截止2007年底，已完成治理面积524.7k㎡，占总水土流失面积为42.1%。目前，除汾河冲积平原区（占流域总面积17.8%）植被情况较好外，其余区域地形破碎，植被稀少，水土流失面积大，治理任务重，汾河流域我市范围现有林地面积82.5k㎡，森林覆盖率2.8 %。由于我市正处在工业化和城市化进程中，经济高速增长，兴建公路、电厂、房地产开发、矿产开发等速度加快，规模逐年扩大，加剧了人为水土流失，保护生态环境的任务十分艰巨。
二、指导思想、总体目标与实施重点
（一）指导思想
紧紧围绕全面建设和再现汾河流域自然生态和秀丽景色，构建和谐文明，改善人居环境，提高人民生活质量的总体目标，按照“能宽则宽，能弯则弯，人水相亲，和谐自然”和以人为本、因地制宜的理念，坚持治理修复与保护并重，统筹经济建设与生态建设协调发展。统一规划，整体推进，做好与“蓝天碧水”、“兴水战略”、造林绿化等重要工程的衔接。突出重点，强化领导，明确责任，依法治理，举全市之力，有效遏制流域内生态环境破坏和恶化的趋势，使之逐步得到修复与有效保护，实现经济社会与自然生态环境的协调发展。
（二）总体目标
通过对流域生态环境的治理修复与保护，以及中上游调入客水和对流域内地表水、中水等水资源的合理调度，确保我市汾河干流145.2公里河道常年至少保持最低生态流量及部分农业灌溉用水，恢复汾河自然流水；通过禹门口黄河提水工程客水调入以及支流河道流域生态治理，逐年补给流域范围地下水，确保地下水止降复升；通过河道疏通和整治，修复河道自然形态，提高河道行洪能力，改善沿河生态环境，促使适宜浅水生物生存的湿地基本得到修复和改善；通过建设一批污水处理设施，使生活和工业污废水达标排放和零排放；通过对新绛古堆泉出露带禁采和保护区的限采措施，以及对古堆泉有影响区域的生态治理与保护，确保古堆泉重点保护区生态恢复；通过种树、种草和有效管护，大幅提高流域内植被绿化和水土保持水平，涵养水源，形成自然生态的良性循环；通过对流域内各种资源的合理开发利用和有效保护，以及对传统产业的提升改造，实现绿色转型，壮大经济实力，增加农民收入，进一步提高人民生活水平；通过建立健全规章制度和生态环境执法体系，推动优化调整产业结构，维护汾河流域生产和经济发展秩序，确保人与自然的和谐发展。总之，通过全市上下十年的共同努力，使汾河流域成为全市最重要的水源涵养带、生态效益带、休闲景观带和富民工程带，成为带动运城经济、社会发展及生态建设的核心区域。
（三）分期实施目标及实施重点
