政企分开后的种子生产经营单位要依照国家和自治区的有关规定，参加企业职工养老、医疗、失业、生育、工伤等各类社会保险。单位和个人应分别按规定的比例缴纳社会保险费，社会保险经办机构按规定为职工建立基本养老保险和基本医疗保险个人账户。
在种子管理体制改革过程中，国有种子企业可通过依法转让和出售其资产取得收入（包括出售自有产权公房、建筑物收入，以及处置企业使用的划拨土地的收入等），用于支付安置职工的各种费用，不足部分由同级财政安排。对已资不抵债的国有种子企业应先清理，分析原因，分清责任，再根据国家有关企业破产的相关规定和实际情况提出解决方案，报当地人民政府批准实施。
3．推进产权制度改革。国有种子企业从农业行政主管部门剥离出来后，应依法进行审计和资产评估，产权不明晰的还应依法进行产权界定。资产评估应委托具有相应资质的中介机构进行，资产评估报告由同级国有资产监管部门进行核准或备案；涉及土地使用权变更的，须委托具有土地评估资质的中介机构进行地价评估，土地资产评估报告由同级土地管理部门审核。要按照《
国务院办公厅转发国务院国有资产监督管理委员会关于规范国有企业改制工作意见的通知》（国办发〔2003〕96号）要求和我区国有企业改革的有关规定，在确保国有资产不流失的情况下，通过产权转让、股份制改造、兼并、破产、出售等多种形式，加快企业改制重组。鼓励非公有制经济参与国有种子企业改革改制。企业管理人员和核心技术开发人员可按照国家有关规定相对控股。各级人民政府要在资金、税收等方面给予重点扶持，鼓励各类性质的骨干种子企业通过收购、兼并等多种形式聚集种子产业生产要素，做大做强种子产业。
（三）完善种子管理体系。
1．建立健全种子管理站。种子管理是农业行政主管部门的重要职责，市、县两级要建立健全相应的种子管理站。要加强种子管理技术支持和服务体系建设，不断完善种子质量检验体系、品种区域试验体系和信息服务体系。市、县种子管理站要依法履行种子行政许可、行政处罚、行政管理等职责，加强对本行政区域内种子市场和种子质量的监管。上级种子管理机构对下级种子管理机构负有指导和监督职责。
2．加强种子管理、服务队伍建设。要按照稳定队伍、转变作风、搞好服务的原则，加强对种子管理人员的教育培训，提高业务水平和依法行政能力。要加强新品种引进试验示范推广工作，规范新品种引进试验示范推广。现有的种子行政执法人员，要通过业务培训，经过资格考核，持证上岗。
