会议强调，鄱阳湖生态水利枢纽工程建设必须科学论证，科学规划，科学决策，科学实施，确保将这项工程建设成为利国利民的关键性工程。在科学论证、科学决策、科学推进过程中，要正确处理好五个关系，即正确处理好生态水利枢纽工程建设与保护湿地、保护候鸟和保护生物多样性之间的关系；正确处理好鄱阳湖流域水环境水资源和长江大流域水环境之间的关系；正确处理好鄱阳湖生态水利枢纽工程与五河流域生态环境保护之间的关系；正确处理好鄱阳湖生态环境的生态保护与科学利用之间的关系；正确处理好当前和长远之间的关系。
会议要求，保护鄱阳湖生态环境必须用系统的思路来谋划，用工程的办法来实施。要着重抓好“保护”、“整治”、“建设”、“管理”四项重要工作。“保护”即切实抓好水资源和水环境保护、湿地的保护、候鸟和生物多样性等的保护；“整治”即扎实开展生态环境的专项整治，年内重点要抓好重点县、乡镇污水排放整治，鄱阳湖区采砂专项整治，“五河一湖”源头保护区内环保专项整治；“建设”即鄱阳湖地区生态环境重点工程建设，年内要着力抓好80个县污水处理设施工程建设。科学论证、科学决策、扎实推进鄱阳湖生态水利枢纽工程的启动，要科学规划，对工程建设、湿地保护、水位控制、航道鱼道畅通以及水利枢纽工程坝下至长江水道进行综合分析、科学论证，做到工程方案的最佳化；“管理”即切实抓好鄱阳湖生态环境的长效管理，理顺管理体制，健全管理机构，强化管理手段，确保管理成效。
会议研究确定了以下事项：
一、省发改委、水利厅、林业厅、山江湖办等有关部门，要继续抓紧组织鄱阳湖生态水利枢纽工程建设的科学论证，抓紧制订工程规划，积极向国家有关部门汇报，主动衔接与沟通，争取国家有关方面的理解和支持，力争今年年内完成论证和规划工作，明年争取国家同意立项。
二、积极理顺鄱阳湖保护与发展的管理机制，权责结合，加强对鄱阳湖的统一有序高效管理。
三、加强对建设鄱阳湖生态水利枢纽工程项目论证、立项、启动的组织领导，在省委的统一领导下，省政府将成立由省政府主要领导任组长，常务副省长、分管副省长任副组长，省发改委、省财政厅、省经贸委、省林业厅、省水利厅、省交通厅、省环保局、省农业厅、省科技厅、省公安厅、省国土资源厅、省建设厅、省卫生厅、省旅游局、省山江湖办等有关部门负责人为成员的领导小组，领导小组办公室设在省发改委，负责日常综合协调工作。
