（四）跨海桥梁区27个，功能区面积共517.9公顷。
重点跨海桥梁区共14个，有海湾大桥、石大桥、牛田洋跨海大桥、虎门大桥、莲花山大桥、淇澳大桥、莲花大桥、横琴大桥、珠海大桥、南门大桥、虎跳门大桥、崖门大桥、镇海湾大桥、湛江海湾大桥。
其他跨海桥梁区共13个，有港口大桥、笠港大桥、濠江大桥、汕头跨海隧道、汕头高速公路大桥、甲东大桥、湖东大桥、长沙湾大桥、盐洲大桥、白寿湾铁路大桥、白寿湾大桥、横门大桥、库竹大桥。
（五）其他工程用海区4个，功能区面积共919.5公顷。
有汕尾连岛公路建设区、深圳西部通道建设区、沙角电厂煤灰池用海区、珠海机场用海区。
第十九条 海洋保护区划定122个功能区，功能区面积共711831.8公顷。
（一）海洋和海岸生态自然保护区51个，功能区面积共259665.7公顷。
重点海洋和海岸生态自然保护区18个，有汕头乌屿候鸟保护区、甲东海洋生态系统保护区、白寿湾海洋生态系统保护区、福田红树林生态系统自然保护区、广州南沙海洋生态示范区、进口浅滩海洋生态系统保护区、淇澳岛海洋生态系统保护区、镇海湾海洋生态系统保护区、南鹏列岛海洋生态系统保护区、阳西程村湾海洋生态系统自然保护区、水东湾海洋生态系统保护区、五里山港海洋生态系统保护区、通明海海洋生态系统保护区、流沙港海洋生态系统保护区、遂溪北部海洋生态系统保护区、徐闻西部海域珊瑚礁生态系统保护区、英罗港海洋生态系统保护区、东沙群岛珊瑚礁和海鸟自然保护区。
其他海洋和海岸生态自然保护区共33个，有潮州南铲海洋生态自然保护区、潮州溜牛礁海洋生态自然保护区、饶平大埕湾海洋生态自然保护区、潮州饶平海岸生态自然保护区、汕头乌屿海洋生态自然保护区、濠江海洋生态自然保护区、苏埃湾海洋生态系统保护区、汕头海门海洋生态自然保护区、田心湾海洋生态系统自然保护区、遮浪汇聚流海洋生态系统保护区、汕尾遮浪角东海洋生态自然保护区、汕尾城区龟龄岛生态功能自然保护区、惠州青洲海洋生态自然保护区、担杆汇聚流海洋生态系统保护区、担杆-佳蓬列岛海洋生态系统保护区、阳江头芦排海洋生态自然保护区、寿长河口海洋生态系统保护区、博贺港海洋生态系统保护区、茂名大放鸡岛海洋生态自然保护区、湛江吴川博茂海洋生态自然保护区、湛江硇洲南海洋生态自然保护区、特呈岛海洋生态系统保护区、北莉口海洋生态系统保护区、南渡河口海洋生态系统保护区、徐闻南部海洋生态系统保护区、迈陈海洋生态系统保护区、营仔海洋生态系统保护区、北潭海洋生态系统保护区、海康海洋生态系统保护区、湛江雷州乌石海洋生态自然保护区、企水海洋生态系统保护区、赤豆寮海洋生态系统保护区、湛江遂溪江洪海洋生态自然保护区。
（二）生物物种自然保护区36个，功能区面积共230377.9公顷。
重点生物物种自然保护区共13个，有南澳赤屿东南海域中国龙虾和锦绣龙虾自然保护区、南澳平屿西南海域南方鲎自然保护区、莱芜中国龙虾海洋自然保护区、莱芜中华白海豚自然保护区、汕头龙头湾中华白海豚自然保护区、汕头濠江企望湾南方鲎自然保护区、揭阳龙虾自然保护区、揭阳海龟和鲎自然保护区、咸台海龟自然保护区、内伶仃岛猕猴自然保护区用海、珠江口中华白海豚自然保护区、茂名放鸡岛文昌鱼自然保护区、雷州白蝶贝保护区。
其他生物物种自然保护区共23个，有饶平中华白海豚自然保护区、企望湾南方鲎自然保护区、三洲澳湖东红卵海胆保护区、汕尾海马自然保护区、港口海龟自然保护区、大岛野生动物放养保护区用海、大襟岛中华白海豚自然保护区、江门广海湾蓝蛤自然保护区、阳江马尾文昌鱼自然保护区、阳西大树岛龙虾自然保护区、阳西青洲龙虾自然保护区、湛江吴川东风螺自然保护区、吴川文昌鱼自然保护区、湛江吴川紫血蛤自然保护区、湛江东南文昌鱼自然保护区、雷州东里栉江珧自然保护区、湛江雷州湾中华白海豚自然保护区、湛江廉江沙虫自然保护区、湛江北潭儒艮自然保护区、雷州流沙湾珊瑚礁自然保护区、雷州海草自然保护区、遂溪中国鲎保护区、湛江角头沙儒艮自然保护区。
（三）自然遗迹和非生物资源保护区9个，功能区面积共1517.9公顷。
重点自然遗迹和非生物资源保护区共5个，有海山海滩岩田地质遗迹保护区、大万山岛浮石湾侵蚀海岸保护区、方济阁文化遗迹保护区、南鹏列岛东水下考古基地保护区、虎头山-晏镜岭海岸地貌保护区。
其他自然遗迹和非生物资源保护区共4个，有淇澳岛沙丘遗迹保护区、神灶温泉资源用海保护区、大澳渔家文化村用海区、阳西青洲岛自然景观保护区。
（四）海洋特别保护区26个，功能区面积220270.3公顷。
重点海洋特别保护区共有12个，有南澎列岛-勒门列岛海洋特别保护区、陆丰碣石湾金厢水产资源特别保护区、汕尾红海湾水产资源特别保护区、海丰县九龙湾海洋特别保护区、大亚湾水产资源特别保护区、沱泞列岛礁盘鱼类特别保护区、乌猪洲省级海洋特别保护区、镇海湾水产资源特别保护区、埠场文蛤种苗增殖特别保护区、大湾贝类种苗增殖特别保护区、丰头河牡蛎天然种苗特别保护区、硇洲海洋资源特别保护区。
其他海洋特别保护区共14个，有潮州饶平乌礁水产资源特别保护区、潮州饶平龙屿水产资源特别保护区、潮州饶平青屿水产资源特别保护区、汕头莱芜水产资源特别保护区、汕头广澳水产资源特别保护区、揭阳市神泉渔业特别保护区、汕尾礁盘鱼类特别保护区、大澳渔业资源特别保护区、阳东浅海水产资源特别保护区、海陵大堤东泥蚶种质资源特别保护区、江城区浅海海洋特别保护区、茂名电白鸡打水产资源特别保护区、茂名竹洲岛水产资源特别保护区、徐闻大黄鱼幼鱼资源特别保护区。
第二十条 特殊利用区划定54个功能区，功能区面积共31397.2公顷。
（一）科学研究试验区7个，功能区面积共2706.0公顷。
重点科学研究试验区共3个，有中科院大亚湾海洋生物综合实验基地用海区、深圳东部海洋生物高新科技产业区、广东省海洋科技园用海区。其中使用大亚湾水产资源自然保护区开展海洋生物综合实验的中科院大亚湾海洋生物综合实验基地，用海范围难以确定，没计算功能区面积。
其他科学研究试验区共4个，有广东南澳科技兴海育苗示范区、汕头大学吴坪寨海洋生物试验区、碣石湾人工优化生态系统及综合开发试验区、小辣甲珊瑚移植试验区。
（二）排污区29个，功能区面积共6892.2公顷。
重点排污区共9个，有惠来电厂排污区、大亚湾石化工业排污区、碧甲重化工业排污区、大亚湾核电站热水排污区、蛇口-赤湾排污区、龙穴岛北排污区、黄埔工业排污区、阳西电厂排污区、茂名乙烯排污区。
其他排污区共20个，有澄海排污区、神泉港污染防治区、乌坎港污染防治区、汕尾港排污区、妈湾排污区、西乡排污区、东宝河口排污区、沙角煤灰场排污区、万顷沙南排污区、南沙排污区、广州经济开发区排污区、大沙地污水处理厂排污区、中山新港排污区、鸡头角排污区、唐家金星门排污区、直辣角排污区、南水南排污区、车旗咀排污区、广海工业排污区、阳江港排污区。
（三）倾倒区18个，功能区面积共21799.0公顷。
重点倾倒区共8个，有汕头港倾倒区、东联港及马鞭洲码头泊位疏浚泥临时海洋倾倒区、黄茅岛倾倒区、高栏岛南海洋倾倒区、荷包岛南海洋倾倒区、阳江核电站疏浚泥临时倾倒区、湛江港25万吨航道疏浚泥临时海洋1号倾倒区、湛江港25万吨航道疏浚泥临时海洋3号倾倒区。
其他倾倒区共10个，有潮州大唐电厂临时海洋倾倒区、汕尾港倾倒区、广东LNG大鹏湾疏浚泥临时海洋倾倒区、铜鼓航道疏浚泥临时倾倒区、九澳岛东南倾倒区、台山倾倒区、华厦阳西电厂临时海洋倾倒区、亚士德水道疏浚泥临时海洋倾倒区、硇洲东海洋倾倒区、南海三类废弃物倾倒区。
