（四）税务部门应依照合法合理的原则，针对当前普遍存在的船员个人所得税费用扣除不合理的问题，进一步完善船员个人所得税费用扣除管理办法。
（五）当年新办、市外引进的航运企业及被列入省重点流通企业、省试点物流企业的市内航运企业，如按规定纳税确有困难，报经地税部门批准，可减或免征房产税、城镇土地使用税和水利建设专项资金。
（六）对在全市新建造船舶在市船舶交易市场办理相关手续的，免收一切费用。对全资引进的市外企业，其原自有船舶在市船舶交易市场交易时收取40%交易费。
（七）有下列情形之一、在市船舶交易市场进行船舶交易的，减半收取船舶交易费：列入本届市优、强名录的航运企业新增运力通过船舶交易市场交易的；市外引进航运企业从市外新购的船舶；以船东名义登记的船舶，在该船东控股成立公司后，该船整船产权过户到公司的；市外注册登记的本市船舶回到市内注册登记的。上述船舶必须为非老旧船。
（八）从市外购入的10000载重吨及以上的普通货船、3000载重吨及以上的一级汽油船、一、二型化学品船和液化气船，船价1000万元以上部分减半收取船舶交易费。上述船舶必须为非老旧船。
四、建立奖励机制
（一）实行多贡献多得益的财政扶持机制。对新办或引进的航运企业，自经营之日起三年内，其实际缴纳税收的地方留成部分超过20万元的，其超过部分分别给予第一年65％、第二年50％、第三年45％的资金补助。对原已在舟山注册且具有一定规模（年计税营业额500万元以上）的航运企业（船舶），以2007年度实缴税收的地方留成部分为基数，其当年实际缴纳税收的地方留成部分超过基数的，对超过部分给予50％资金补助；其基数内部分继续按原航运扶持政策兑现资金。考虑到政策的连续性，原注册在县（区）的航运企业（船舶），自2008年度起给予一定过渡期，即2009年底前可继续享受已出台的航运扶持优惠政策，2010年起全市航运企业（船舶）统一执行上述超基数补助，基数内补助不再实行新的政策。企业实缴税收地方留成部分仅限指海运营业税和企业所得税，不含其它税费。新政策执行期间县（区）不再出台航运业扶持政策。
（二）鼓励航运企业优化运力结构。航运企业新造、新购或引进船龄在18年以下、载重吨在2000吨及以上的特种运输船（指化学品船、集装箱船、散装水泥船、冷藏船）、载重吨在5000吨及以上的成品油船和载重吨在10000吨及以上的普通货船，并在舟山注册缴纳营业税的，由政府安排专项资金，在新增船舶投入使用的当年按企业净增加的吨位数给予每吨20元的补助。获得补助的船舶必须在本市注册连续满五年，不足五年的，其补助金按年均比例退还。新增运力来自在舟山注册的船舶和已获得省运力补助的船舶，均不享受此政策。
