第三十七条 定点医疗机构必须为参合农民就医提供优惠，尤其要根据本院实际，给予挂号费、床位费、检验费等项目的优惠。同时根据本医院级别制定单病种收费标准，并向社会公布。
第三十八条 实行逐级转诊及双向转诊制度。参合患者在市内定点医疗机构之间转院，或患危重症、癌症、精神病等特殊病种到非定点和市外医疗机构治疗的，不须办理相关转院手续；因医疗条件或病情需要转到市外医疗机构治疗的，由二类或三类定点医疗机构出具转院证明。定点医疗机构要严格转诊制度，既要保证需要转诊的病人及时转院和治疗，又要控制不应该转诊的病人转出，同时上级医疗机构也要及时将恢复期和康复期病人转回定点基层医疗机构继续康复治疗，以减轻农民疾病经济负担，保证合作医疗资金的合理使用。
因急诊、抢救或在外地生病不能按规定程序到市定点医疗机构住院或转诊的，可以在就近具备住院条件的医院治疗，但必须在住院七日内由患者亲属或委托人向市合管办报告，并办理相关手续。
第三十九条 定点医疗机构应单独建立合作医疗资金收付账目，做到日清月结，一月一上报，一月一结账。每月的前五个工作日为定点医疗机构报送上个月结算材料时间，经经办机构审核后，每月向定点医疗机构核拨一次结算费用。
第四十条 做好新农合和农村医疗救助制度的有效衔接工作。市民政部门应与卫生部门协商，并与新农合定点医疗机构签订协议，明确医前、医中救助及费用支付规定。定点医疗机构应积极配合，按照民政部门提供的医疗救助花名册和服务协议，开展门诊和住院医疗费用救助工作。对于医疗救助对象住院，应免收住院押金，先行安排住院治疗，并执行住院补偿零起付。
第四十一条 实行医疗服务质量保证金和检查评估制度。市合管办每月从定点医疗机构的结算费用中预留5%的医疗服务质量保证金，并定期组织检查评估和进行年终考核，按考核评估结果予以返还。考核结果还将作为奖罚及续延定点资格的依据。医疗服务质量保证金的管理办法由市合管办参照市城镇居民基本医疗保险相关办法制定。
第七章 基金监督
第四十二条 市政府成立由有关部门人员及人大代表、政协委员、参合农民代表共同组成的农村合作医疗监督委员会（其中农民代表占20%），每年定期检查、监督基金使用和管理情况。
第四十三条 市合管办应加强对合作医疗基金的预警监测，定期向市合管委汇报合作医疗基金的收支、营运、管理及服务等情况。市合管委应定期向市合作医疗监督委员会和市人大汇报工作，主动接受监督。
