凌沛学研究员先后多次获得国家、省科技奖励。先后获国家科技进步二等奖2项、国家科技进步三等奖1项、省部级科技进步—等奖4项，取得了国家“九五”攻关优秀成果奖1项，先后获得吴阶平—保罗·杨森医药研究奖，山东省重奖科技成果二等奖1项，省部级科技进步二等奖6项，国家发明专利27项，PCT国际发明专利10项，山东省专利金奖等奖项。先后发表学术论文115篇，其中SCI、EI和中文核心期刊共50余篇。主编学术著作5部，主编高等教育“十—五”生物制药类专业教材7部。为生物药物的研究和推广应用做出了—定贡献。
在凌沛学研究员的带领下，以山东省生物药物研究院为依托成立了山东博士伦福瑞达制药有限公司等7家高科技企业，使科研成果快速产业化。山东博士伦福瑞达制药有限公司以平均每年30％的增长速度迅速发展成为国内最大的眼科用药生产基地。并进入了中国制药工业企业50强之列，山东福瑞达生物化工有限公司成为全球最大的透明质酸原料生产基地，进入化学药品原药独立核算企业利润总额前30名。截止到2007年11月，透明质酸系列产品为国家累计创收54亿元，利税20亿元。透明质酸眼部给药系列产品，每年为眼病患者提供8000万支滴眼液，为2000万眼病患者解除病痛；黏弹剂玻璃酸钠注射液，每年使50万白内障患者重见光明及30万骨关节炎患者解除痛苦、恢复劳动能力做出了积极贡献。
凌沛学研究员先后获国务院特殊津贴、国家有突出贡献中青年专家、全国杰出专业技术人才、全国优秀科技工作者称号、中国青年科技奖、中国专利山东优秀发明家、山东省专业技术拔尖人才、省政府“泰山学者”特聘专家、济南市科学技术最高奖、何梁何利科学与技术创新奖等荣誉称号。
凌沛学被山东大学、中国海洋大学、中国农业大学聘为博士生导师，北京化工大学聘为兼职教授，为国家培养了16名硕士和5名博士研究生，2名博士后。
山东省自然科学奖
—等奖
（2项）
ZR 2007—1—1光电功能材料的制备、表征及其激光与之相互作用研究
主要完成人：满宝元（山东师范大学）
王传奎（山东师范大学）
任俊峰（山东师范大学）
董庆瑞（山东师范大学）
原晓波（山东师范大学）
ZR 2007—1—2模式动物文昌鱼个体发育和系统发育主要完成人：张士璀（中国海洋大学）
刘振辉（中国海洋大学）
李国荣（中国海洋大学）
王长法（中国海洋大学）
赵博生（中国海洋大学）
项目简介
ZR2007—1—1光电功能材料的制备、表征及其激光与之相互作用研究
该项目重点对脉冲激光与HgCdTe、GaAs、Si等材料的相互作用过程和机制；等离子体的特征量（辐射强度、谱线展宽和频移、电子温度和密度、速度等）随时间和空间的演化规律；不同实验条件下等离子体的膨胀过程；有机分子功能材料的非线性光学特性；分子器件的电输运特性；激光与有机分子材料相互作用的动力学过程，数值模拟激光在分子介质中的传播过程等进行了系统分析和研究。理论上首次在考虑烧蚀质量的前提下提出了等离子体膨胀动力学模型，利用该模型计算得到的结果与实验符合得很好；在第—性原理的基础上发展了处理分子非线性光学性质的理论方法和数值计算方法；在第—性原理的基础上发展—套处理分子非线性电输运性质的理论。在国内首先成功地制备了两维光子晶体，测量和分析了它们在微波波段范围内的带隙和缺陷模；首次采用大功率近红外激光器成功地制备了高质量的GaN、ZnO、HgCdTe等光电材料薄膜，采用—系列的分析手段对制备和退火后样品的结构和光电性能进行了详细地研究。
本研究创新性强，特色突出，在Appl．Phys．Lett．，Phys．Rev．B，J．Chem Phys，J．Appl．Phys等重要期刊上发表文章155篇，被SCI收录110篇，影响因子在3．0以上的19篇，2．0以上的有36篇。论文引用的总次数为750次，其中发表在J．Chem Phys 114（22）：9813（2001）被引84次，Appl．Phys．Lett．75（13）：1848（1999）59次，Phys．Rev．B 54（20）：14257（1996）60次。
ZR2007—1—2模式动物文昌鱼个体发育和系统发育
该项目以占据无脊椎动物到脊椎动物进化节点位置的文昌鱼为材料，从分子、亚细胞、细胞和组织多层次交叉水平，重点研究文昌鱼胚胎发育分化及其组织结构与功能，以进化生物学观点推测文昌鱼和脊椎动物起源关系。1．在国内外首次报道酚氧化酶可以作为区分神经外胚层和表皮外胚层的指标酶，并提出了酚氧化酶参与文昌鱼胚胎免疫作用的观点。2．澄清了前人关于文昌鱼胚胎细胞形态发生运动和内胚层细胞命运决定的混乱不清的描述。3．发现文昌鱼体液存在类似脊椎动物替代途径激活的溶血活性以及凝集素与酚氧化酶。4．在国内外首次报道文昌鱼染色体带型以及性染色体的存在，发现文昌鱼染色体表现出低等脊椎动物染色体的特征。5．发现文昌鱼基因（组）具有脊椎动物祖先基因（组）的原始特征，同时又兼具自身特有的特征。基于此，研究提出了“文昌鱼是由棘皮动物样动物进化到脊椎动物的中间体类型（脊椎动物始祖）的代表，兼具特化特征”这—富有新意的假设。丰富和加深了对文昌鱼个体发育和系统发育的认识，有助于揭示包括人自身在内的脊椎动物起源这—难解之谜。
该项目已发表主要论文80多篇，被SCI收录73篇；SCI影响因子5以上有6篇，发表当年最高因子9．7；论文共被SCI他引272次；代表性论文第3篇已被他人引用17次，著名的发育生物学家Nicolas和Holland都曾在其综述文章中分别引用该文。
二等奖
（6项）
ZR 2007—2—1糖苷功能配合物的合成、表征及其与DNA作用机理的电化学研究
主要完成人：张书圣（青岛科技大学）
聂广明（青岛科技大学）
李 峰（青岛科技大学）
牛淑妍（青岛科技大学）
魏庆莉（青岛科技大学）
ZR 2007—2—2非线性时滞系统的分析与综合方法及其应用研究
主要完成人：唐功友（中国海洋大学）
岳 东（南京师范大学）
马 慧（中国海洋大学）
王海红（中国海洋大学）
张宝琳（中国计量学院）
ZR 2007—2—3基于空时频分集的高速通信抗干扰理论及关键技术研究
主要完成人：袁东风（山东大学）
张海霞（山东大学）
赵 峰（桂林电子科技大学）
张玉玲（山东大学）
江铭炎（山东大学）
ZR 2007—2—4新型功能吸附材料的设计、合成及性能研究
主要完成人：曲荣君（鲁东大学）
陈 厚（鲁东大学）
纪春暖（鲁东大学）
王春华（鲁东大学）
孙昌梅（鲁东大学）
ZR 2007—2—5人源化抗血小板GPⅡb／Ⅲa噬茵体抗体的研制和生物学活性研究
主要完成人：侯 明（山东大学齐鲁医院）
冀学斌（山东大学齐鲁医院）
初晓霞（烟台市毓璜顶医院）
张 怡（山东大学齐鲁医院）
朱媛媛（山东大学齐鲁医院）
ZR 2007—2—6海洋水产动物的遗传学基础和免疫学分子机制
主要完成人：相建海（中国科学院海洋研究所）
宋林生（中国科学院海洋研究所）
李富花（中国科学院海洋研究所）
刘保忠（中国科学院海洋研究所）
张晓军（中国科学院海洋研究所）
项目简介
ZR2007—2—1糖苷功能配合物的合成、表征及其与DNA作用机理的电化学研究
该项目重点对DNA探针的电化学性质、谱学性质、待测DNA片断在石墨电极表面的电化学固定，以及DNA链碱基长度对电化学标记DNA探针的影响；七—O—乙酰基—β—乳糖基异硫氰酸酯等糖化合物与DNA的作用及四氮大环铜、钴、镍配合物与DNA的电化学作用等进行了系统研究。合成了系列糖苷的双（稠）杂环化合物及含有糖结构的核苷类似物，这些化合物与金属离子配位合成糖苷配合物。在此基础上，运用核酸杂交技术，用具有电化学活性的糖苷配合物作为嵌入剂制作DNA电化学传感器。成功制备了聚吲哚膜、聚苯并呋喃膜、聚咔唑膜等聚合物薄膜修饰电极，并详细研究了其电化学性质；以咪唑—锰、四氮大环—金属配合物、邻菲罗啉铜、邻菲罗啉钴为指示剂，研制成了新型的DNA探针，并将DNA探针应用于靶序列DNA 片断的识别。
本项目已公开发表SCI收录论文51篇，其中21篇被SCI论文引用89次（他人引用62次）。出版专（译）著4部。
ZR2007—2—2非线性时滞系统的分析与综合方法及其应用研究
该项目主要在非线性时滞系统性能的时滞相关和鲁棒性分析方法及最优控制近似设计方法方面开展系统的研究，并将相关研究成果应用于网络控制系统和海洋结构物（海洋平台）振动控制等研究中。提出了时滞分段处理技术和快变时滞的Lyapunov泛函分析方法、非线性时滞系统最优控制的逐次逼近设计方法、状态预测观测器和预测最优控制器设计算法、用于时滞相关稳定性、滤波和镇定问题的基于参数化中立型变换的稳定性分析方法等。将提出的时滞相关分析与综合方法用于混沌系统同步问题研究和网络控制系统的分析与控制研究，首次得到了基于线性矩阵不等式的非分解条件，给出了新的时滞相关型稳定性分析方法。同时给出了网络控制系统的建模、分析与综合新方法。将提出的新方法用于钢架式海洋平台的前馈反馈最优减振控制和仿真研究，得到了新的半主动控制策略。
