第十三条 实行保底补偿制度，对因病情特殊，住院费用核算补偿所得金额低于住院医药费用20％的，按20％给予补偿。住院费用保底补偿额不得超过封顶线。
第六章 封顶线标准
第十四条 封顶线以一个年度内累计实际获得的补偿金额计算。住院医疗费用补偿封顶线3万元，救助对象住院费用封顶线3．5万元。特大病种（恶性肿瘤、尿毒症、心脏病手术）封顶线5万元。
第十五条 救助对象在经过合作医疗补偿后，按照农村牧区医疗救助的规定，进行救助补偿。两项补偿实际补偿额不得超过住院医药总费用。
第七章 补偿范围
第十六条 慢性气管炎、慢性肺原性心脏病、冠心病、慢性乙型肝炎、类风湿性关节炎、高血压病、糖尿病、慢性宫颈炎、耐药性结核病、消化性溃疡、慢性风湿性心脏病、盆腔炎、慢性肾炎、慢性胰腺炎、中风后遗症、慢性胆囊炎、血友病、痛风等18种慢性病纳入慢性病门诊费用补偿范围。
第十七条 慢性病门诊费用实行分段按比例补偿，不设起付线，年终一次性结算。补偿比例为：1000元以内补偿50％，1000元以上补偿30％，每人每年最高补偿600元。
第十八条 慢性病门诊补偿费用首先从家庭账户基金中列支，不足部分从大病统筹基金中支付。
第十九条 农牧区各类意外伤害，如山体滑坡、火灾、雪灾、水灾等不可抗拒的自然灾害，以及房屋倒塌、交通事故等当中受伤人员的医药费用可以纳入补偿范围，如另有补偿规定的按有关规定执行。有责任方的意外伤害医药费用应当由责任方承担，不纳入补偿范围。
第八章 基金监管
第二十条 各级新农合经办机构要严格执行财政部、卫生部关于新农合基金财务和会计制度的有关规定，确保新农合基金安全、规范运行。
第二十一条 加强新农合基金监管，做到经办机构、财政专户、财会制度、代理银行和工作规程“五统一”，基金审计、费用公示、监委会监督、农牧民监督、社会监督“五结合”。
第九章 医疗服务管理
第二十二条加强乡、村两级卫生专业技术人员培训，提高医疗服务质量。加强药品使用管理，为农牧民提供价廉、质优的药品。充分发挥中藏医药特色优势，开展适宜的中藏医药服务。
