3、经营支出、经营利润的核算情况，经营利润是否按规定申报缴纳了企业所得税。
（四）个人所得税代扣代缴情况
1、对所属公务员（员工）从不同渠道支付的工资、奖金、补助等应税所得是否依法足额代扣代缴了个人所得税。
2、对支付的劳务报酬、租金分红、集资利息、礼品、礼金等是否足额代扣代缴了个人所得税。
3、单位内部实行了科室承包并取得经营收入的，主管单位是否按规定向税务机关提供了相关信息，是否督促内部承包科室按规定办理了相关税务手续，科室承包承租经营收入是否按规定申报缴纳了相关税收。
（五）房产税申报缴纳情况
1、门面、房屋出租收入是否按规定申报缴纳了房产税。
2、经营用房是否按规定申报缴纳了房产税。
（六）土地使用税申报缴纳情况
自收自支、自负盈亏的事业单位是否按规定申报缴纳了土地使用税。
（七）兴建的各类办公用房、门面及其他用房是否按规定取得了“建筑安装发票”，是否按规定代征和申报缴纳了地方税收。
（八）其他地方各税申报缴纳情况
四、检查步骤与要求
（一）第一阶段，宣传培训、自查补报（8月底至9月10日）。
各级地税部门要召开行政事业单位税收专项检查动员会议，下发宣传辅导资料，集中组织培训。地税部门要深入行政事业单位进行调查摸底、宣传动员和纳税辅导，大力宣传税收政策，引导各级行政事业单位按照税法要求，对纳税情况进行自查。所有行政事业单位要在全面自查的基础上，如实填写自查申报表，按税务机关要求报送，并及时足额补缴税款。凡在自查补报期间主动向税务机关补缴税款的，可减轻或免予行政处罚。行政事业单位的自查面要求达到100%。
（二）第二阶段，重点检查（9月11日至10月31日）。
按照“统一领导、地税牵头、分级负责”的要求，由各级地税部门对辖区内的行政事业单位进行全面检查。地税部门要全面掌握行政事业单位的税源状况及经营、财务情况，运用正确的检查方法，依法进行检查。在实施税务检查过程中，各级地税机关和税务检查人员要严格遵守税法和有关工作纪律规定，坚持依法行政、阳光执法、廉洁办税，规范检查行为，确保检查质量，保证税款及时入库。重点检查面要求达到100%，检查税款入库率达90%以上。各行政事业单位要积极配合地税部门的检查，自觉履行纳税义务。
