按本预案1.4分级原则，特别重大鼠疫疫情（Ⅰ级）由卫生部予以确认；重大鼠疫疫情（Ⅱ级）由卫生部或省卫生厅予以确认；较大鼠疫疫情（Ⅲ级）由设区市以上卫生行政部门予以确认；一般（Ⅳ级）鼠疫疫情，由县级以上卫生行政部门予以确认。
6.2 鼠疫应急反应的终止
鼠疫疫区控制工作按中华人民共和国国家标准《
人间鼠疫疫区处理标准及原则GB15978-1995》的要求全部完成相应应急处置工作，经验收大、小隔离圈内已达到灭鼠灭蚤标准及环境卫生标准，连续9天内无继发病例，疫区疫情控制临时指挥部可提交解除疫区封锁申请。
特别重大鼠疫疫情（Ⅰ级）应急反应的终止，按照《国家鼠疫控制应急预案》的规定执行。重大鼠疫疫情（Ⅱ级）、较大鼠疫疫情（Ⅲ级）、一般鼠疫疫情（Ⅳ级）分别由省、设区市、县级人民政府卫生行政部门组织有关专家进行分析论证，提出终止应急反应的建议，报本级人民政府或本级鼠疫应急处理指挥部批准后执行，并向上一级卫生行政部门报告。
6.3 鼠疫疫情处理工作评估
6.3.1 评估人员组织
对特别重大鼠疫疫情（Ⅰ级）、重大鼠疫疫情（Ⅱ级）、较大鼠疫疫情（Ⅲ级）、一般鼠疫疫情（Ⅳ级）处理情况的评估，分别由国家、省、设区市、县级人民政府卫生行政部门组织相关人员组成评估小组，开展评估工作。
6.3.2 评估内容主要包括：疫区自然地理概况，发生疫情的原因，传染源、传播途径和流行因素，疫情发生、发展和控制过程，患者构成，治疗效果，染疫动物、蚤种类的分布，染疫动物密度和蚤指数，所采取措施的效果评价、应急处理过程中存在的问题和取得的经验及改进建议。评估报告报本级人民政府和上一级人民政府卫生行政部门。
7.保障措施
7.1 技术保障
7.1.1 完善省、市、县三级鼠疫监测体系建设，制定省级鼠疫监测点的能力标准。省级鼠疫监测点实行系统监测，积累资料并开展应用性科研。有鼠疫自然疫源分布地的县（区），要按照因地制宜、固定与流动监测相结合、以流动监测为主的原则，合理设置监测点，扩大监测覆盖范围。各级医疗机构应开展鼠疫防治知识培训工作，对鼠疫病例（含疑似病例）实行“首诊医生责任制”。
7.1.2 提高鼠疫的应急反应能力。依据国家“鼠疫应急装备标准”，规范各地鼠疫应急队伍、装备和应急物资储备。制订各级疾病预防控制机构“鼠疫实验室建筑规范”和“鼠疫实验室装备规范”，改善疾病预防控制机构的基础设施和实验室设备条件。加强鼠疫防治专业队伍建设，提高流行病学调查、现场处置和实验室检测检验能力，通过培训和应急演练提高应急队伍的反应水平和能力。
