盟质量技术监督局负责组织应急物资的质量监督、检测工作，确保应急物资的质量达到国家规定标准。
盟食品药品监督管理局负责组织开展重大食品事故的查处，负责突发公共卫生事件应急处理药品、医疗设备和器械等的监督和管理。
锡盟移动分公司和锡盟电信分公司负责组织、协调各电信运营企业为突发公共卫生事件应急处理（包括报告）提供通信保障工作。
锡林浩特机场公司协助卫生行政部门作好乘坐飞机人员的检疫、查验工作，防止传染病通过航空运输环节传播；优先保障突发公共卫生事件处置人员及防治药品、器械等物资的航空运送。
锡林浩特火车站负责作好出入火车站和乘坐人员的检疫、查验工作，及时将发现的传染病病人和疑似传染病病人移交指定的医疗机构处理，防止传染病通过铁路运输环节传播；确保铁路安全畅通和优先保障突发公共卫生事件处置人员及防治药品、器械等急用物资和有关标本的运送，做好疫区铁路交通管理工作。
二连出入境检验检疫局负责作好发生突发公共卫生事件期间，口岸出入境的卫生检疫、传染病监测、卫生监督和卫生处理工作，并及时收集和提供国外传染病疫情信息。
武警锡盟支队要配合有关部门作好突发公共卫生事件应急处理行动，配合公安机关做好事件现场的控制等工作。
其他相关部门根据本部门工作职责和突发公共卫生事件处理的需要，组织做好紧急物资调运、市场监督管理、污染扩散的控制及全盟突发公共卫生事件应急指挥部交办的相关工作等。
2.1.2 旗县市（区）级突发公共卫生事件应急指挥部组成
旗县市（区）级突发公共卫生事件应急指挥部由本级人民政府有关部门组成，政府主要领导担任总指挥，按照属地管理原则，负责对本行政区域内突发公共卫生事件应急处理的协调、指挥，并作出处理本行政区域内突发公共卫生事件的决策，决定采取的措施。
2.2 日常管理机构
成立全盟卫生应急办公室，设在盟卫生局，负责全盟突发公共卫生事件应急处理的日常管理工作。
主要工作职责：依法组织协调突发公共卫生事件应急处理工作；负责卫生应急工作规划的起草工作；组织协调建立和完善公共卫生事件监测和预警系统；组织制定全盟突发公共卫生事件应急预案；组织综合性卫生应急知识和处理技术的培训与演练；协调承办救灾、反恐、中毒、放射事故等重大安全事件中涉及公共卫生问题的组织协调工作；负责全盟突发公共卫生事件信息的收集和报告工作；协调组织对突发重大人员伤亡事件的紧急医疗救援工作。
2.3 专家咨询委员会
根据工作需要，由盟卫生局提出并组建全盟突发公共卫生事件应急处理专家咨询委员会。
主要工作职责：
（1）确定突发公共卫生事件级别以及提出相应措施的建议。
（2）对突发公共卫生事件应急准备提出咨询建议。
（3）参与制订、修订突发公共卫生事件应急预案和技术方案。
（4）对突发公共卫生事件应急处理进行技术指导。
（5）对突发公共卫生事件应急反应的终止、后期评估提出咨询意见。
（6）承担突发公共卫生事件应急指挥机构和日常管理机构交办的其他工作。
旗县市（区）卫生行政部门根据本行政区域内突发公共卫生事件应急工作需要，组建本地的突发公共卫生事件应急处理专家咨询委员会。
2.4 应急处理专业技术机构的职责
各级、各类医疗机构、疾病预防控制机构、卫生监督机构、出入境检验检疫机构是突发公共卫生事件应急处理的专业技术机构。应急处理专业技术机构要结合本单位职责开展专业技术人员处理突发公共卫生事件能力培训，提高快速应对能力和技术水平。发生突发公共卫生事件期间，要按照卫生行政部门的统一安排，开展应急处理工作。
2.4.1 医疗机构
主要负责病人的现场抢救、运送、诊断、治疗、医院内感染控制，配合疾病预防控制机构对病人进行流行病学调查和检测样本采集。
2.4.2 疾病预防控制机构
主要负责突发公共卫生事件报告，现场流行病学调查处理（包括对有关人员采取观察和隔离措施，采集病人和环境标本，环境和物品的卫生学处理等），开展病因现场快速检测和实验室检测，加强疾病和健康监测。
旗县级疾病预防控制机构负责辖区内突发公共卫生事件的现场流行病学调查、处理和实验室检测工作。盟疾病预防控制机构协助、指导旗县疾病预防控制机构开展工作。
