2008年1月起，在纺织染整、化学工业、造纸、钢铁、电镀、食品制造（味精和啤酒）、污水处理行业开展化学需氧量排放指标有偿使用试点，对直接向环境排放且占用化学需氧量排放指标的排污单位征收排放指标有偿使用费。
氨氮、总磷排放指标有偿使用执行时间另行规定。
第四条 主要水污染物排入城镇污水集中处理单位实行处理的排污单位，暂免征有偿使用费，但应承担城镇污水集中处理单位有偿取得排放指标的合理成本。
第三章 排放指标的申报与核定
第五条 对排污单位排放指标实行按年度申报、核定的办法。
第六条 排污单位应当按照排污申报规定，在每年2月底前向环保行政主管部门申报当年排放指标。
第七条 环保行政主管部门按照总量控制和减排的总体要求及国家、省有关太湖水污染综合治理的规定，根据排污单位达标排放总量、排污申报及削减比例，在每年3月底前核定、下达排污单位当年可使用的排放指标，同时抄送同级价格主管部门、财政部门，并向社会公示。
第八条 新建、改建、扩建和技术改造项目（不包括淘汰项目）新增排放指标应满足总量控制和环境质量的要求，并经环保行政主管部门核准后，按本办法规定有偿取得，或通过招标、公开拍卖、二级市场购买等方式有偿取得。
第九条 排污单位发生改制、改组、合并或分立等变更行为的，其变更后的排放指标不得超过原核定的排放指标。确需增加的，按第八条规定执行。
第十条 排污单位排入城镇污水集中处理单位进行处理的，由城镇污水集中处理单位向环保行政主管部门申报排放指标。
排污单位应当向环保行政主管部门提供城镇污水集中处理单位接纳处理证明，不能提供的，按直接向环境排放行为处理。
第十一条 因环境违法行为被各级政府或环保行政主管部门责令关停、取缔的排污单位，其排放指标由环保行政主管部门无条件收回；排污单位自行关闭的，其未使用排放指标由环保行政主管部门按规定回购，回购的排放指标作为储备指标，在符合总量控制和污染减排的要求下可以有偿出让。
