根据上述指导思想和原则，编制全省主体功能区规划要妥善处理好几个方面的关系。
一是处理好开发与发展的关系。围绕科学崛起、和谐崛起，坚持集约发展、协调发展、可持续发展，促进科学合理、有序适度开发，实现经济社会又好又快发展。
二是处理好全局与局部的关系。推进形成主体功能区要从全局利益出发，在坚持中央统一部署的基础上，统筹考虑全省国土资源空间，做到局部服从全局、全局兼顾局部，谋求全省整体利益、长远利益的最大化。
三是处理好近期与长远的关系。主体功能区一经确定，不能随意更改，近期保持稳定，远期可根据经济社会发展和资源环境承载能力的变化，依照程序和规定调整主体功能定位，主要是重点开发区域调整为优化开发区域。
四是处理好主体功能与其他功能的关系。主体功能区要突出主要功能和主导作用，同时不排斥其他辅助或附属功能。优化开发和重点开发区域的主体功能是集聚经济和人口，但其中也要有生态区、农业区、旅游休闲区等；限制开发区域的主体功能是保护生态环境，但在生态和资源环境可承受的范围内也可以发展特色产业，适度开发矿产资源。
五是处理好行政区与主体功能区的关系。编制主体功能区规划，需要打破行政区界限，改变完全按行政区制定区域政策和绩效评价的方法，同时，主体功能区规划的实施，也需要依托一定层级的行政区。
六是处理好各类主体功能区之间的关系。各类主体功能区之间要分工协作，相互促进。优化开发区域要通过向重点开发区域转移产业，减轻人口、资源大规模跨区域流动和生态环境的压力；重点开发区域要促进产业集群发展，增强承接限制开发和禁止开发区域超载人口的能力；限制开发、禁止开发区域要通过生态建设和环境保护，提高生态环境承载能力，逐步成为全国或区域性的生态屏障和自然文化保护区域。
七是处理好各类规划的关系。主体功能区规划是统领各级各类规划的基础性、战略性和约束性规划，同时，主体功能区规划要以国民经济和社会发展总体规划、土地利用规划、城镇规划、生态建设和环境保护规划等各类规划为支撑，加强衔接协调，充分利用已有的规划成果。
八是处理好各项政策手段的关系。要加强政策手段的衔接配套，形成有利于推进形成主体功能区、有利于消除各级政府顾虑、有利于充分调动各级政府积极性的政策体系。省政府文件
三、明确规划编制主要任务
