依据市政府下达的主要污染物总量减排年度目标，对照实施的治理工程减排项目、结构调整减排项目、监督管理减排项目清单逐项核算，并汇总化学需氧量和二氧化硫减排总量，减排总量在扣除新增量后满足年度减排目标要求的得50分，否则直接认定其未完成年度减排目标，不再往下计算考评分值。
二、治理工程减排项目建设及运行情况（20分）
（一）城市污水处理厂（8分）：按照规定要求完成城市污水处理厂建设任务的，计4分，未完成城市污水处理厂建设任务时，未建成1家扣2分，扣完为止；运行的城市污水处理厂达到污染减排核查要求、正常运行的计4分，城市污水处理厂被核查发现有不正常运行的，每家每次扣0.5分，扣完为止（注：不正常运行情况的判定按照《
“十一五”主要污染物总量减排核查办法（试行）》执行，下同）。
（二）燃煤电厂脱硫工程（8分）：按照规定要求完成燃煤电厂脱硫工程建设任务的，计4分，有1家燃煤电厂脱硫工程未建成，扣2分，扣完为止；已投入运行的燃煤电厂脱硫工程达到污染减排核查要求、正常运行的计4分，发现有不正常运行的，每家每次扣0.5分，扣完为止。
（三）企、事业单位污染减排工程（4分）：按照要求建成污染减排工程的，计2分，有1家污染减排工程未建成，扣0.5分，扣完为止；建成的污染减排工程达到污染减排核查要求、正常运行的计2分，发现投入运行的污染减排工程有不正常运行情况的，每家每次扣0.2分，扣完为止。
三、结构调整减排项目建设及运行情况（20分）
（一）按照要求完成年度重点流域区域环境综合整治任务的，计10分，规定任务中有一项任务被认定未完成的，得0分。
（二）完成污染减排计划年度实施方案中企业关停、淘汰任务的，计10分，有未关停、未淘汰情况的或者其完成结果达不到结构调整减排标准要求的，发现1家扣3分，扣完为止（注：结构调整减排标准执行《
“十一五”主要污染物总量减排核查办法（试行）》中的相关规定）。
四、污染减排其他任务完成情况（10分）
（一）污染减排“三大体系”运行情况（3分）：督查核实当地污染减排“三大”体系建设完善、运行情况良好，计3分，日常督察中发现“三大体系”未能正常运行的，不正常运行一个体系即扣1分，扣完为止。
