州委宣传部：按照疫情控制的统一部署和有关部门、地方的请求，做好疫情处理的宣传报导。宣传鼠疫防治知识，提高公众预防与保健意识。
州发展和改革委员会：负责组织应急疫苗、药品、医疗设备和器械、防护用品以及生活必需品的储备和调度，保证供应，维护市场秩序，保持物价稳定。
州教育局：对学生进行鼠疫防治知识宣传教育，协助做好疫情处理工作。
州科技局：协助提供鼠疫疫区处理所需技术，支持相关科学技术研究。
州公安局：协助做好鼠疫疫区封锁，加强疫区治安管理和安全保卫工作，协助开展交通检疫、堵截鼠疫患者及染疫物品。
州民政局：对符合救助条件的鼠疫患者提供医疗、生活救助。
州财政局：做好鼠疫控制应急资金的安排并及时拨付，加强资金管理监督。
州交通局：按照《
国内交通卫生检疫条例》及其实施方案，负责职责范围内的交通卫生检疫工作，组织做好站（场）内发生的鼠疫疫情应急处理工作，优先运送疫情处理人员、药品器械和有关物资。
州电信局：负责组织、协调各电信运营企业为鼠疫疫情应急处理（包括报告）提供通信保障工作。
州农牧局：负责做好疫区家畜的鼠疫动物病防疫和动物防疫监督工作。
州经贸委：及时组织调运疫区人民生产、生活所必需的物资，维护市场秩序。
州林业和环保局：负责疫区野生动物异常情况的监测，并在疫情发生时，协助做好疫情发生地的隔离工作。
州民族宗教事务局：积极协助做好疫区应急处理中涉及民族和宗教的相关工作。
州旅游局：组织旅游全行业认真做好鼠疫疫情的预防和应急处理工作。
州红十字会：充分发挥志愿者作用，协助相关部门在疫区内广泛开展鼠疫预防知识宣传普及工作，提高公众的防护意识。
黄南军分区和武警黄南支队应完成营区内的疫情处理任务，并协助和支持地方做好疫情控制工作。
其它有关部门根据本部门职责和鼠疫应急处理的需要，组织做好紧急物资的供应、市场监管并积极完成州鼠疫疫情应急处理指挥部交办的各项工作任务。
2、各县鼠疫应急指挥部的组成和职责
各县鼠疫应急指挥部由相应级别人民政府有关部门组成，各县人民政府分管卫生工作的负责人担任总指挥，负责对本行政区域内鼠疫疫情应急处理的协调和指挥，做出本行政区域内鼠疫疫情处理的决策，决定拟采取的重大措施等事项。相应职责如下：
