2、认证范围界定存在违反规定情况。环通认证公司对萍乡月池天然矿泉水公司认证时，在瓶装水源没有取得国家天然矿泉水技术评审鉴定证书情况下，将认证范围界定为“瓶（罐）装饮用天然矿泉水生产和服务”。北京中润兴公司2006年12月发给江西卫岗乳品公司的体系认证证书中，其认证范围界定为“‘卫岗’牌奶制品生产和服务”，实际上从2006年6月起，该企业就没有了使用“卫岗”注册商标的合法授权。
3、个别机构从事超范围认证活动。2007年1月19日，国家认监委2007年第2号公告注销了北京兴国环球认证公司HACCP认证资格，但兴国环球公司仍于2007年2月9日开展了对江西昌顺生物科技公司保持HACCP认证的注册资格审核。
4、存在影响审核活动公正性行为。哈特福德全球标准认证（北京）有限公司的监审计划由江西哈特福德标准咨询有限公司安排，监督服务费也由该咨询机构收取。中检认证公司对江西康帝实业公司进行QMS和HACCP审核时，存在中检认证公司江西分公司（实为办事处）收取认证费用、参与初次现场审核人员曾对企业进行过体系认证培训等问题。北京中经科环质量认证有限公司执行的监审费用转入广州中安质环企业管理服务公司帐户。
5、审核活动的规范性不够。部分认证机构存在审核人日数严重不足的问题。如北京中安质环在对江西武林啤酒公司进行初审时，计划审核4个人日，实际执行1个人日。北京陆桥认证中心对喜盈盈（江西）食品公司进行初审核时，计划审核4个人日，实际执行2个人日。北京世标认证中心对赣州华荣保健食品公司进行监审时，第2次与第3次监审间隔16个月。深圳鹏程公司对江西樟树市樟树贡酒公司的初审与第1次监审间隔1年，严重超过其认可规范规定的在6个月内进行监审的规定。
6、证后监管不规范。有的认证机构对失效证书没有及时回收，或在监管部门对企业进行检查前几天突击发出暂停或注销证书的通知。
（二）获证企业的问题
1、对食品方面新法规的学习和贯彻执行不够重视。本次检查的获证企业，基本上都没有安排《
食品召回管理规定》等新法规的学习和贯彻落实计划，基本上没有建立有关食品召回方面的管理措施。
2、部分企业管理存在“两张皮”现象。不能将质量管理体系的运行与企业日常经营管理结合起来，造成体系认证与日常管理“两张皮”现象。少数企业质量负责人不知道有关内审、管理评审等活动，不能提供质量手册、程序文件及体系运行记录。
