经过多年的建设和发展，我市综合实力跨上一个新台阶，经济社会发展和激烈的竞争对科技的需求比以往任何时候都更加迫切，我们只有紧紧抓住新技术革命和国家实施中部地区崛起战略的机遇，充分发挥后发优势、区位优势，加强技术创新，加速科技进步，才能后来居上，实现我市经济社会的跨越式发展。
二、指导思想与发展目标
（一）指导思想
“十一五”我市科技发展的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面贯彻落实科学发展观，深入实施科教兴巢战略，认真落实“企业主体、自主创新、引进消化、支撑发展、引领未来”的新时期科技工作方针，把推动企业自主创新摆在全市科技工作的中心环节，作为调整经济结构、转变增长方式、提高产业核心竞争力的首要推动力量。不断加大科技投入力度，优化科技发展环境，培育新兴产业，引领未来经济社会发展。依托合肥、南京等周边城市的科教资源优势，以集成创新和引进技术消化吸收再创新为重点，启动实施一批重大科技专项，开发一批拥有自主知识产权的高新技术产品，培育一批具有核心竞争力的高新技术企业和名牌产品，锻炼一支自主创新能力强的科技骨干队伍，壮大一批以产学研结合为纽带的国家和省级企业技术中心，支撑全市经济社会的持续协调发展。
（二）发展目标
到2010年，全市企业自主创新能力显著增强，攻克一批共性关键技术，形成一批具有自主知识产权和较强竞争力的名牌产品和企业；科技对经济社会发展的支撑和引领作用显著增强，高新技术产业增加值占生产总值的比重达到10%以上，每万元生产总值能耗较“十五”末下降20%；科技支撑条件明显改善，全社会研发投入占生产总值的比重达到1.5%；有利于增强自主创新能力的全民创新创业环境初步形成。
三、支撑重点领域发展，提升产业科技水平
围绕经济社会发展目标，确定5个重点领域和8个重大专项。重点领域指我市经济社会发展中重点发展、亟待科技提供支撑的产业和行业。重大专项指在确定重点领域的同时，结合我市优势或特色产业，进一步突出重点，筛选出若干重大战略产品、关键共性技术或重大工程作为重大专项。
确定重点领域和重大专项的基本原则：一是有利于促进主导产业竞争力的整体提升；二是有利于将资源优势转化为产业优势；三是有利于衔接并争取国家和省的科技重大专项落户巢湖；四是有利于科技公共服务能力的增强。
