“十五”期间，我市经济持续快速增长，综合实力明显增强，科技工作的基础得到了明显改善。“十一五”期间，我市经济和社会发展将进入一个新的历史阶段，科技工作也将面临着一个更加开放、竞争的外部环境。虽然与发达地区相比，我市科技发展总体水平还存在较大差距，但只要我们抓住机遇，发挥后发优势，就完全有可能实现跨越式发展。
二、指导思想和预期目标
（一）指导思想
“十一五”期间我市科技工作的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，围绕加快滁州奋力崛起、全面建设小康社会的总体部署，以自主创新、成果转化为重点，着力提升科技创新能力和科技成果转化吸收能力，积极推进科技成果产业化，引领和支撑经济社会的跨越式发展。
面对新形势、新任务，“十一五”期间全市科技工作的总体思路是：市场导向，开放合作，突出重点，自主创新，实施跨越。
市场导向：充分发挥市场在资源配置中的基础性作用，促进技术、市场和资本的紧密结合，使企业成为技术创新的主体。
开放合作：实施东向发展战略，积极融入长三角，加强科技成果的引进吸收和再创新。
突出重点：提升支柱产业的竞争力，发展高新技术产业，支持具有比较优势的领域出成果出人才。
自主创新：大幅度提高创新能力，力争取得一批具有自主知识产权的技术成果。
实施跨越：引领和支撑经济社会的跨越式发展。
（二）预期目标
大力发展高新技术产业。到“十一五”末，高新技术产业技工贸总收入达到91.5亿元，年均递增18%以上。
加快用高新技术及先进适用技术改造和提升传统工业。继续实施制造业信息化工程，提高制造业信息化水平。推行循环经济模式和清洁生产工艺。提升企业的装备水平和经济技术水平，到“十一五”末，达到全省中上等水平。
积极发展民营科技企业。到“十一五”末，民营科技企业总数达到450家，年技工贸总收入达到80亿元。进一步提高全市民营科技企业的整体技术水平，重点扶持10家民营科技企业做大做强。
进一步促进农业科技进步，为建设社会主义新农村提供技术支撑。到“十一五”末，主要农作物的良种覆盖率达到100%，其中优质良种覆盖率达到50%；畜、禽、水产品良种普及率达到95%以上。积极采用农产品精深加工技术，使农产品深加工产值占农业总产值的比重有较大提高。
为全市经济和社会可持续发展提供技术支撑。“十一五”期间，推广一批节水、节能、节材、节地、人口与健康等领域的先进技术，为建设节约型、环保型、安全型社会提供技术保障。
