（1）制定农作物生物灾害预警、预防、控制和处置工作计划，组建和完善农作物生物灾害的监测和预警系统。
（2）收集、汇总和发布灾害信息，掌握动态，指导各县（市、区）的农作物生物灾害的预防、控制和处置行动。
（3）向成员单位传达上级有关部门和市应急指挥部的工作指示，通报工作动态。
（4）组织开展农作物生物灾害的预防、控制和应急处置行动，负责农作物生物灾害防范的宣传、教育和培训工作。
（三）技术咨询机构
市应急指挥部设立专家咨询委员会，由市农业局负责组建。专家咨询委员会由农业科研、教育、推广、气象、生态等方面的专家组成。其职责为：
1、向市应急指挥部提出农作物生物灾害的风险评估意见和预警，为启动本预案提供技术咨询。
2、提供农作物生物灾害预防、控制、应急处置的技术咨询和参谋。
3、提出并实施农作物灾害预防、控制和处置技术的攻关研究。
4、研究分析成灾原因，提出恢复农业生产的建议意见。
（四）县（市、区）农作物生物灾害应急指挥机构
县（市、区）政府依照本预案组织指挥体系的构成，成立县（市、区）农作物生物灾害应急指挥机构，在市应急指挥部的领导下，分级负责，指挥本地区农作物灾害的预防、控制和应急处置行动。在县（市、区）农业行政主管部门设立办公室，负责本级农作物生物灾害应急指挥机构的综合协调和日常管理工作。参照市应急指挥部专家委员会的组成，结合本地实际，设立县（市、区）农作物生物灾害应急专家组。
三、灾害分级
根据《浙江省农作物生物灾害应急预案》和农作物生物灾害的性质、种类、波及范围和危害程度等，将灾害分为三级，Ⅰ级（特别重大农作物生物灾害）、Ⅱ级（重大农作物生物灾害）、Ⅲ级（较大农作物生物灾害）。
（一）Ⅰ级（特别重大农作物生物灾害）
1、危害农作物的迁飞性虫害、流行性病害经预测发生趋势为大发生，或已经产生危害，成灾面积为省内该作物播种面积的25%以上，控制难度较大的；
2、发现从国外、省外传入我省或我省局部已发生的检疫性外来有害生物，经风险分析综合评估风险极大、特别危险的；
3、其他特殊情况需要划为Ⅰ级（特别重大农作物生物灾害）的。
（二）Ⅱ级（重大农作物生物灾害）
1、危害农作物的迁飞性虫害、流行性病害经预测发生趋势为大发生，或已经产生危害，成灾面积为我市内该作物播种面积的25%以上，控制难度较大的；
