上级业务部门不得干预下级部门的机构编制事项，不得要求下级部门设立与其业务对口的机构或提高机构规格，不得要求为其业务对口的机构配备或增加编制。各业务部门制定的行业标准，不得作为审批机构编制的依据。
四、加快机构编制管理法制化规范化建设
进一步加强机构编制管理的法制建设，完善国务院机构设置和编制管理条例，认真贯彻落实
地方各级人民政府机构设置和编制管理条例；制定部门职责分工协调办法，加大职责分工协调力度；完善各级党政部门主要职责、内设机构和人员编制规定，在明确各部门职能的同时必须逐项明确其应承担的责任，并增强其规范性、可操作性和严肃性。
不断探索和完善行之有效的机构编制管理办法。试行机构编制实名制管理制度，凡按规定批准成立的党政机关和事业单位都要实行定编定员，确保具体机构设置与按规定审批的机构相一致、实有人员与批准的编制和领导职数相对应。加强机构编制标准的研究制定工作，根据工作需要对现行标准进行修改完善，制定更加符合实际的有关机构编制标准。逐步建立机构编制公开制度，对不涉及国家秘密的机构编制及其执行情况，要通过有效形式向本单位工作人员或社会公开，接受监督。建立健全机构编制管理工作考核和评估制度。完善机构编制统计和报告制度，确保统计数据准确、及时、全面。
五、建立健全机构编制部门与相关部门间的协调配合和制约机制
机构编制部门与相关部门要密切配合，各负其责，形成合力。强化机构编制管理与组织（人事）管理、财政管理等的综合约束机制。只有在机构编制部门审核同意设置的机构和核批的编制范围内，组织（人事）部门才能配备人员和核定工资，财政部门才能列入政府预算并核拨经费，银行才能开设账户并发放工资。
对超编进入的人员，组织（人事）部门不得办理录用、聘用（任）、调任手续、核定工资，财政部门不得纳入统发工资范围，公安等部门不得办理户口迁移等手续。对擅自增设的机构，财政部门不得纳入政府预算范围、核拨经费，银行不得开设账户。
各地区各部门要严格执行机构编制规定，不准超编进人，不准擅自设立机构和提高机构规格，不准超职数、超机构规格配备领导干部，不准以虚报人员等方式占用行政和事业编制、冒领财政资金。
六、加大机构编制监督检查力度
