日常监督检查的内容随着监管力量的不断加强而逐步扩大。根据目前的实际情况，现阶段日常监督检查的主要内容包括：
（1）特殊药品生产企业的月、季巡查。特殊药品使用单位的有关检查；
（2）药品生产企业接受药品及医疗机构制剂委托加工的现场检查及抽样（由稽查处将抽样任务计入分局的抽样指标中）；
（3）其他日常监督检查的内容
--被检查单位是否正常生产（配制）或停产；
--《药品生产许可证》、《医疗机构制剂许可证》登记事项、许可事项变动是否通过审批；
--被检查单位组织机构、质量负责人、生产负责人、药检室负责人的变动是否进行备案，生产（配制）条件和检验条件的变动是否通过审批或备案；
--被检查单位生产（配制）和质量管理自检情况、季度汇总情况；
--物料管理情况；
--药品不良反应与用户投诉情况；
--被检查单位接受监督检查后的整改情况；
――其它有关GMP执行情况等。
根据国家局的要求，2007年将分阶段逐步在血液制品、疫苗及其它注射剂产品生产企业试行“驻厂监督员制度”。试点的血液制品、疫苗生产企业的日常监管主要由试点工作小组承担，辖区分局应积极配合试点工作的进行。
三、日常监督检查的管理
1、组织监督检查时，应当制订检查方案，明确检查标准。可通过网络（市局近期将建立药品生产企业和医疗机构制剂室日常监管网络）了解被检查单位近期接受检查情况，决定检查的具体内容。
2、必须有两名以上检查人员实施监督检查。检查人员对被检查单位的信息资料负保密责任。
3、如实记录现场检查情况，检查结果以书面形式告知被检查单位。
4、对检查中发现的违法、违规问题，应移交同级稽查部门，由稽查部门根据《
中华人民共和国药品管理法》、《
中华人民共和国药品管理法实施条例》、《
药品生产监督管理办法》、《医疗机构制剂配制监督管理办法》（试行）等有关法律、法规进行处罚。
