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“十一五”时期，围绕《纲要》确定的能源、水资源、生态建设和环境保护技术，装备制造业及材料产业技术，现代生物技术及产业化，农产品精深加工技术四大科技发展战略重点，以及能源、水和矿产资源、环境、农业、制造业、信息产业及现代服务业、新材料、生物技术、人口与健康及公共安全九个重点技术领域，突出当前经济社会发展和增强自主创新能力的战略需求，启动实施重大科技专项和优先项目。
1重大科技专项
按照《纲要》确定的重大科技专项和逐项设计、充分论证、分批实施、稳步推进、动态调整的实施原则，“十一五”期间实施以下10个重大科技专项，并根据发展中的实际情况，确定有限目标，选择其中部分重点技术方向，进行设计论证，成熟一个，启动一个。
（1）黄河上游（甘肃段）草场退化防治及水源地生态环境修复。重点集成开发高寒区退化草场植被修复技术、高寒区沙化土地综合防治技术、人工优良牧草栽培技术及天然草场恢复技术、湿地生态系统修复和管理技术、鼠害生物控制技术以及监测管理技术等。
（2）内陆河流域水资源合理配置及荒漠化治理。以石羊河流域水资源合理配置及生态治理共性关键技术研究与示范为重点，建立内陆河流域荒漠化治理技术模式。重点开发祁连山水源涵养生态恢复技术、绿洲高效节水生态农业技术、绿洲边缘退化生态系统恢复技术、流域水土资源信息化管理技术等。
（3）风能发电及设备。重点进行风能发电共性关键技术研发，积极推进兆瓦级风力发电机产业化，在风力发电控制系统、风机叶片、塔架研发及成套化方向坚持引进消化吸收再创新，力争取得重大进展。
（4）新材料技术。重点研究开发我省有优势的有色金属新材料、精细化工新材料、稀土材料、无机化工新材料、纳米材料等。引进消化吸收再创新国内外先进技术，开展新工艺流程研究和新材料产业信息化建设，建立新材料科技创新体系，带动材料产业跨越发展。
（5）装备制造。重点研究开发石油钻采及炼化设备、矿山机械、数控机床、电工电气、真空设备、控制设备、军工电子设备、高压容器、大型快锻机组、大型板式换热设备、风动工具、精密试验设备、核仪器仪表等制造技术，不断提升装备制造技术水平，加快产品的更新换代。
（6）冶金、化工、建材等流程工业节能及清洁生产技术与装备。重点研究开发冶金、化工、建材等流程工业的主要高效节能技术与装备，开发应用有色、冶金、石化、建材等领域清洁生产、矿山及矿产资源综合利用、生产流程降耗减污的核心、共性技术。
（7）动植物品种创新与产业化。以麦类（小麦、啤酒大麦）、玉米、马铃薯、小杂粮和油料（油菜、胡麻）、棉花等6类主要作物和肉羊、肉牛、奶牛、优质瘦肉型猪、细毛羊、特种经济动物等6类动物品种创新为重点，转基因技术、航天育种技术、动物胚胎移植技术与常规技术相结合，培育高产、优质、抗病虫、抗逆的优良、专用动植物新品种，综合集成种质资源保存技术，建立和完善有优势的种子规模化制种技术平台和动植物良种繁育基地，并加快相应技术的扩展和产业化。
（8）农产品精深加工。重点开展优质农畜产品的贮藏、保鲜、精深加工、包装、储运环节的关键共性技术创新与应用，提高加工工艺与设备技术水平。重视生物催化转化农产品工业化成套技术的开发和创新。重视农畜产品质量安全检测技术开发与应用。
（9）新药创制及特色中药现代化。研究中药新药创制模式、实验室和临床评价方法与标准体系，重点开发以复方药为主的中药新药，加强新药的二次深度开发。在优势领域坚持开发研制新的生物制药技术及生物制剂、疫苗和药品。建立完善药效及安全性评价、制剂与质量控制、中试和生产工艺等技术支持平台。开展道地中药材质量标准、中药材规范化种植技术研究和种植基地建设。
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