各单位缴纳的水利建设基金可计入成本。
第八条 设区市、杨凌示范区（以下简称市）、县级水利建设基金的来源：
（一）国有土地出让金的10%；
（二）有防洪任务的城镇，从征收的城市维护建设税中划出15%纳入水利建设基金，专项用于城市防洪工程建设；
（三）省级水利建设基金返还部分。
第九条 下列项目免征水利建设基金：
（一）经国务院、国务院财政部门和省人民政府批准减免的专项基金（资金）和收费；
（二）民政部门管理的社会福利事业、企业单位和残联管理的企事业单位的收入；
（三）农田灌溉水费收入；
（四）其他经省人民政府批准减免的项目。
第十条 行政事业性收费及政府性基金应当缴纳的水利建设基金由各级财政部门按规定比例进行划转。非农业建设征收（用）、占用耕地应当缴纳的水利建设基金，由各级财政部门负责征收，其余由各级地方税务部门负责征收。
第十一条 水利建设基金纳入基金预算管理。各市、县（仅限于省政府确定的有重点防洪任务的市县）按规定从城市维护建设税中划转的水利建设基金，年终决算时，由市、县一般预算转入基金预算；各市、县从国有土地出让金中划转的水利建设基金作为市、县本级的基金预算收入，入基金预算的840507科目。除此之外，各级征收机关征收和划转的其他水利建设基金一律就地缴入当地国库，为省级基金预算收入。其中从行政事业性收费及政府性基金中划转的水利建设基金入基金预算的840501科目；其他征收的水利建设基金入基金预算的840509科目。
第十二条 各级财政、税务部门征收水利建设基金，应当使用由省财政部门统一印制的“水利建设基金专用票据”，实行税费同征的地税部门可以用税务票据代替。各级财政部门划转水利建设基金由其向同级国库（实行基金预算管理的）、或者向同级财政内部开具“水利建设基金划转通知单”，相关部门根据划转通知单的要求将资金划入基金预算的840501科目。
第十三条 水利建设基金应按时缴纳，逾期不缴的除限期追缴外，从滞纳之日起按日加收2‰的滞纳金，并入水利建设基金。对拒不缴纳的单位和个人，征收部门可持“专用扣缴通知书”通知当地银行扣缴。
