2.县级兽医行政管理机构：全州各县成立畜牧兽医局，属县政府正科级事业局（红原县在原有基础上进行规范），核定事业编制10名（包括工勤编制2名），其中，科级领导职数2名（局长1名，副局长1名），行政管理人员参照公务员制度进行管理，履行兽医行政管理职责。
上级兽医管理机构对下级兽医管理机构负有指导职责；各级兽医管理机构对本行政区域内动物防疫、检疫工作有指导和监督职责。
（二）建立健全州、县动物防疫行政执法和监督机构
1.州级动物防疫行政执法机构
在州动物防疫监督站挂阿坝州兽医执法支队的牌子，作为州级兽医行政执法机构。机构不升格，其主要负责人按副县级高配，隶属州畜牧兽医局。现有编制22人，技术支持职能分离后，编制减少到15人，设科级领导职数2名（站长1名，副站长1名）。主要职责是：依法负责动物防疫、检疫、动物产品安全监管和畜产品加工企业驻厂检疫等行政执法工作；负责兽医医政和兽药药政管理；负责全州基层畜牧兽医站的管理和指导。
州动物防疫监督站映秀办事处（原漩口办事处）的动物防疫公路检查职能，按属地管辖原则划归汶川县，办事处人员由州畜牧局商州、县人事局、编办妥善安置。
2.县级动物防疫行政执法机构
在县动物防疫监督站挂县兽医执法大队牌子，作为县级兽医行政执法机构。机构不升格，其主要负责人职务按副科级高配，隶属县畜牧兽医局。主要职责是：依法负责本县动物防疫、检疫、动物产品安全监管和畜产品加工企业驻厂检疫等行政执法工作；负责兽医医政和兽药药政管理；负责乡镇畜牧兽医站的管理和指导。
（三）建立州、县动物防疫技术支持机构
1.成立阿坝州动物疫病预防控制中心
按照《
四川省人民政府关于推进兽医管理体制改革的意见》（川府发〔2006〕17号）关于“在整合现有兽医技术支持机构、职责和资源的基础上，按照综合设置的原则，组建动物疫病预防控制机构，作为兽医管理机构和动物防疫监督机构的重要保障和依托，承担动物疫病监测、诊断、流行病学调查研究等技术研究和推广工作”的要求，州成立动物疫病预防控制中心，属正科级公益类事业单位，隶属州畜牧兽医局，接受州动物防疫监督站的业务领导。核事业编制10人，从州动物防疫监督站原有编制中调整7人，新增编制3人，设科级领导职数2名（主任1名，副主任1名），其中，1名科级领导职数从州动物防疫监督站划转。
