湿地保护区管理机构的主要职责：
（一）贯彻执行有关湿地保护的法律、法规、规章和方针、政策；
（二）制定湿地保护区的建设和管理制度；
（三）统一管理、监督和综合协调湿地保护区的规划、建设和保护工作；
（四）调查湿地自然资源并建立档案，组织环境监测；
（五）组织或者协调有关部门开展湿地保护区的科学研究工作；
（六）进行湿地资源保护的宣传教育；
（七）监督在湿地内开展的参观、旅游等活动；
（八）法律、法规、规章赋予的其他职责。
各有关行政主管部门依法对湿地保护区管理机构的工作进行指导和监督。
第十九条 各县（区）林业行政主管部门应当按照国家和自治区、拉萨市的有关规定组织对湿地资源的普查、区域调查和专项调查，并将结果上报本级政府和市林业行政主管部门。
第二十条 各县（区）林业行政主管部门应当建立湿地资源档案管理制度，负责保管湿地资源保护、管理和研究工作中获得的各项成果、数据和资料，并报市林业行政主管部门备案。
第二十一条 在湿地范围内勘查、开采矿产资源或者从事道路、水利、电力、通讯等开发建设活动需占用或者征用湿地的，须严格履行审批手续。未经市林业和环境保护行政主管部门、国土资源规划部门同意的，其他部门不得受理占用、征用湿地申请。
对涉及湿地的各类建设项目，必须严格执行环境影响评价制度和“三同时”制度，报经有审批权的环境保护行政主管部门、国土资源规划部门审批。
根据《建设项目分类管理名录》，涉及湿地的各类建设项目均列为环境敏感区，按环境敏感区编制环境影响报告书（表）。
第二十二条 确实需要临时使用湿地的，须向湿地保护区管理机构提出使用申请。临时使用湿地不得超过二年，不得改变湿地的性质、功能或者修筑永久性建筑物。
第二十三条 各县（区）人民政府应当采取措施保护湿地水资源。对水资源失去保障的湿地保护区，应当建立补水机制。
