（二）综合治理，标本兼治。源头治理和末端治理相结合，治标和治本相结合。治标-保证支流污水尽量不进入主流；治本-对污染源进行源头控制，在源头截留处理。
（三）重点推进。围绕大幅削减河道主流全年污水排放总量这个中心，抓住主要矛盾，科学取舍，治理主要污染源和严重污染支流。
（四）因地制宜。选取最切合区域或流域实际情况的污水收集方式和处理方式。
（五）远近结合。排水体系和污水处理设施建设应考虑长远规划和2007年底近期目标相结合。
（六）经济合理。治污措施选择一方面要投资省，见效快；另一方面要运行成本低，稳定可靠，确保正常运行。
三、方法和措施
各区（市）县应按照境内水系布局状况，将出口或出境断面水质不达标的小流域作为重点整治对象，进行污染状况调查，制定小流域治理方案并组织实施。
小流域治理应点（城镇和聚居区）、线（河道）、面（面源污染）结合，鼓励使用投资省、运行费用低、运行稳定可靠的治污新技术。通过城镇污水处理设施建设、河道治污工程、生态河道建设、农村沼气技术应用等措施，把污水处理在小流域之内。
（一）治理重点污染源和集中污染源。对重要城镇和居民聚居区实行污水截流，切断所有入河排污口（包括流入小流域内和直接汇入主流的排污口），纳入现有的或2007年底之前能够形成的收集管网和污水处理设施进行处理；若无可利用的管网和污水处理设施，则采取应急措施，在末端收集污水，修建小型污水处理设施。
（二）河道水污染治理。
1.在污染严重的支流河道上利用生物处理技术、生态处理技术、土地处理技术等，开展河道水污染治理，改善和提高支流出口断面水质。
2.河道整治工程建设应充分考虑河道生态保护和修复，提高河道自净能力。
（三）设立河流生态缓冲区。在河流两岸纵深范围内确立生态缓冲区，在缓冲区内实施农村改水改厕，普及沼气池和植物塘，充分收集人畜粪便和其他污染物，实现固液分离和消毒杀菌，减少面源污染，促进生态种植业的发展。
各区（市）县应通过小流域治理，实现汇入市管以上河道的出口断面水质达标。跨区（市）县或共界的小流域应本着“齐抓共管”的原则，可各自治理达标出境，或共同治理，或下游治理、上游补偿，保证治理目标的实现。
四、中心城区及周边区域的工作重点
