以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，贯彻中央科技工作指导方针，围绕奋力崛起，全面建设小康社会的总体部署，实施“创新推动”战略。坚持市场导向、适度超前、开放联合、双轮驱动和重点突破，构建区域创新体系，提高自主创新能力和产业竞争力，支撑和引领经济社会的跨越式发展，走有安徽特色的创新型崛起之路，建设创新型安徽。
建设创新型安徽，核心是把增强自主创新能力作为发展科学技术的战略基点，作为调整产业结构、转变增长方式的中心环节，作为奋力崛起、实现跨越式发展的首推力量。把自主创新作为重大战略，贯穿到各项工作和措施当中。以观念创新为前提，以科技创新为支撑，以制度创新为保障，转变发展观念，创新发展模式，提高发展质量，加快发展速度，增强综合竞争力。
建设创新型安徽，关键要把握以下要点：
坚持市场导向。发挥市场在资源配置中的基础性作用，将市场价值的实现作为衡量技术创新的主要标准，强化企业在技术创新中的主体地位，促进技术、市场与资本的紧密结合。
坚持适度超前。围绕经济社会发展的需求，把握国际国内科技发展的方向，以适度超前的新技术研究和应用为重点，加强适用技术普及推广和前沿技术原始创新，支撑发展，引领未来。
坚持开放联合。广泛利用国内外的科技资源，加强引进技术的消化吸收和再创新。主动融入长三角，走以我为主、开放联合的创新之路。
坚持双轮驱动。加强体制创新和科技创新协调互动，促进科技与经济紧密结合。加强科技宏观管理和统筹协调，探索建立产学研结合和寓军于民的体制机制，激发和释放各类创新主体的活力。
坚持重点突破。以科技创新为依托，突出“861”行动计划，提升重点行业和产业的竞争力；突出合肥、沿江和沿淮城市群，打造区域经济增长极；突出优势领域，培育新的经济增长点；突出以人为本，鼓励全民创业创新，促进人与自然、社会协调发展。
第二节 发展目标
到2010年，具有安徽特色的区域创新体系框架基本形成，合肥成为全国有重要影响的科技创新基地；创新能力大幅度提高，攻克一批共性关键技术，发明专利授权量年均增长30%以上；科技对经济社会发展的支撑和引领作用显著增强，高新技术产业增加值占生产总值的比重达到10%，每万元生产总值能耗较“十五”末下降20%；科技发展支撑条件明显改善，全社会研究开发投入占生产总值的比重达到1.5%，初步建立布局合理、特色鲜明、设施完备、运转高效的科技基础条件平台；为建设创新型安徽奠定坚实的基础。
到2020年，全省区域创新体系进一步完善，合肥率先成为国家科技创新型城市；形成一大批具有自主知识产权和较强竞争力的企业，建成若干国内一流、国际有重要影响的高校和科研机构；科技进步与创新成为经济社会发展的首要力量，科技进步贡献率达到60%以上，关键技术自给率大幅度提高，高新技术产业增加值占生产总值的比重达到20%；全社会研究开发投入占生产总值的比重达到2.5%，科技综合实力超过全国平均水平；进入创新型省份行列。
第三节 总体部署
一是加强共性技术攻关，支撑和引领经济社会发展。组织实施优势产业提升、高新技术跨越、现代农业和可持续发展4项科技行动，确定14个重点领域、下设40个优先主题，实施11个重大专项，力争攻克一批共性关键技术，拥有一批自主知识产权。
二是构建区域创新体系，提高自主创新能力。组织实施区域创新示范、技术创新引导、创新平台建设和创新人才培养4项科技工程，抓好一批市、县和乡（镇）创新试点，培育一批创新主体，建设一批创新平台，培养一批创新人才，夯实科技发展的基础。
三是创新体制机制，优化创新环境。落实深化科技体制改革、扩大对外开放、依法推进科技进步和创新、实施专利战略和技术标准战略、加大科技投入和政策扶持力度、进一步加强对科技工作的领导等政策措施，营造激励自主创新的社会氛围，激发市场主体活力和创新动力。
第三章 加强共性技术攻关，支撑和引领经济社会发展
围绕经济社会发展的总体部署，确定若干重点领域、优先主题和重大专项，加强共性技术攻关。重点领域是指我省重点发展的产业和行业。优先主题是指在重点领域中基础较好、有望取得突破的技术群。重大专项是指在重点领域和优先主题的基础上，进一步凝炼、筛选出的重大产品、工程和共性关键技术。
重点领域、优先主题和重大专项的确定原则：一是要解决制约我省经济社会发展的重大共性关键技术问题，提升产业核心竞争力，突破瓶颈制约。二是依托现有基础，加强联手互动，实现资源集成。三是坚持优势优先，突出我省优势产业、优势资源和优势学科。
第一节 实施优势产业提升科技行动
