(三)部分财政支农资金投入不到位或被挤占挪用。
一是40个县本级虚增支农投入、配套资金不到位等5.35亿元，占财政支农资金投入总额的10.8%。如湖南省汉寿县在编制2001和2002年财政决算报表时，虚增支农投入7725万元。2002年7月，重庆市巫溪县政府为了得到天然林保护工程基本养老保险金补助110万元，承诺当年安排等额配套资金，但至审计调查时尚未兑现。
二是有的财政和农业主管部门批复项目和拨付资金不及时，造成资金年终大量结转，名义上的这部分支农投入实际并未到位。46个县两年财政支农资金结转分别为3.45亿元和5.74亿元，占当年应投入资金的15%和18%。如湖北省阳新县近两年收到的上级财政支农资金中，分别有1493万元和969万元到当年12月份才收到，分别占资金总额的74%和45%，致使无法及时拨付，投入未实现。
三是50个县挤占挪用财政支农资金4.95亿元，主要用于平衡财政预算、弥补经费、出借、经营、建房买车等，占财政支农资金投入总额的10%。如云南省马龙县财政局2002年12月初将1000万元烤烟专项资金拨到各相关乡镇和单位后，当月底划回用于平衡财政预算。四川省南部县财政局2002年直接扣减应付乡镇的农村税费改革转移支付补助653万元，用于抵扣乡镇应缴的农业税。1999年至2003年6月，山西省平遥县农机局挪用财政支农资金81.58万元，用于该局自身的副食品基地建设和职工福利等支出。
(四)部分财政支农资金使用效益不佳，用于主管部门自身支出比例偏高。
主要是部分项目建设没有达到计划要求，有的项目管理薄弱、建设质量差。另外，农业等主管部门人员工资和公用经费支出比例偏高，也影响财政支农资金对农业生产的支持力度。50个县2001和2002年财政支农资金投入中，平均有26.7%和27.6%被用于农林水气等部门的事业费，在县本级的投入中这一比例更高，平均为58.4%和58.8%(西部县高达72.5%和78.4%)。如新疆伊宁县1999至2002年，农林水事业单位人员由1358人增加到2018人，增长49%，导致财政支农资金用于非生产性支出的比重则由2001年的64.8%上升到2002年85.2%。
三、产生上述问题的原因及建议
从审计调查情况看，产生上述问题的主要原因：一是现有法规对各级财政在支农投入上的责任、范围和重点等还不够明确，缺乏操作性强的规范要求。二是县财政供养人员多，负担重，自给能力弱，无力更多地投入农业。三是支农资金投入渠道多，有的资金未纳入财政预算管理，有的在建设内容、实施范围上有交叉，不利于严格管理和监督。四是有些地方政府及有关部门重争取资金和分配指标，而对加强管理，提高资金使用效益重视不够。
