第二十七条 项目、课题经费开支范围及标准等相关经费管理规定按照《
国家科技支撑计划专项经费管理办法》执行。
第二十八条 在研课题的年度结存经费，结转下一年度继续使用。项目、课题因故终止，由项目、课题承担单位财务部门牵头，项目、课题负责人协助及时清理账目与资产，编制财务报告及资产清单报国土资源部财务主管部门。国土资源部财务主管部门组织清查处理，结余经费（含处理已购物资、材料及仪器、设备的变价收入）由国土资源部收回，按财政部关于结余资金管理的有关规定执行。
第二十九条 国土资源部对专项经费拨付使用情况进行监督检查，专项财务检查或评估结果作为调整项目、课题预算安排的重要依据。。
第五章 质量管理
第三十条 专项实行分级负责、严格规范的质量管理制度，对批量深部科学数据的采集质量严格把关。专项办公室负责组织制定数据采集的质量验收规定，细化考核指标，统一安排验收和质量抽查工作。项目承担单位负责提出相关数据采集工作规范和指标要求，经专家委员会讨论通过后实行，配合专项办公室做好野外数据质量验收。课题承担单位按工作规范组织实施数据采集，确保数据采集质量，提交符合验收要求的相关文档。专项办公室会同项目承担单位组织对野外数据采集质量进行验收，验收合格的数据方可汇交入库，未通过验收的应提出限期整改要求，或重新采集。
第三十一条 专项实行工程技术监理制度。根据专家委员会建议，确定反射地震、折射地震、天然地震、大地电磁等批量地球物理数据采集与野外施工、地球化学样品采集与测试分析、重要钻探工程监理重点，实行全程质量监理。根据需要，专项办公室聘请有资质的相关科技服务、监理机构（或专家）提出监理方案，经专项领导小组审核同意后实施。
第三十二条 专项办公室组织专家组或委托第三方监审机构，每年对课题工作进展、工作质量和取得成果进行抽查，必要时进行野外现场检查，对课题工作成效进行评估，评估结果作为课题是否继续支持的重要依据。
第六章 成果管理
第三十三条 专项采集的原始数据实行实时备份汇交机制。项目、课题实施过程中采集完成且达到验收要求的批量原始数据，以及最终成果数据必须在数据获取后60天内备份汇交到专项办公室，由专项办公室统一存储、管理和维护。
