（一）负责水专项技术方向和集成方案设计，以及总体进度把握；
（二）负责研究并提出水专项具体实施计划和年度计划的建议；
（三）负责水专项主题、项目间的协调；
（四）参与对水专项项目（课题）的检查、评估和验收工作；
（五）向水专项办提出任务调整或经费调整的建议；
（六）负责编制水专项年度研究进展报告、阶段成果报告、验收报告，并进行水专项成果集成。
技术总师、副总师要求是水专项领域的战略科学家和领军人物，能够集中精力、主要从事水专项的组织实施。水专项总体专家组成员要求是水专项相关领域技术、管理等方面的复合型优秀人才，能够将主要精力投入水专项的具体实施工作。
主题专家组是水专项主题实施的技术责任主体，对总体专家组负责。其主要职责是：
（一）负责主题技术方向和集成方案设计；
（二）研究并提出主题实施计划和年度计划的建议；
（三）负责本主题下设项目（课题）间的协调、交流，把握各项目（课题）的总体研究进度；
（四）参与对本主题下设项目（课题）的检查、评估和验收工作；
（五）向水专项办和总体专家组提出项目（课题）任务调整或经费调整的建议；
（六）编制主题年度研究进展报告、阶段成果报告、验收报告，负责主题成果的集成。
重点流域技术组由总体专家组、主题专家组的有关成员、地方政府代表等相关专家组成，对总体专家组负责。其主要职责是：
（一）协调重点流域内各主题、项目（课题）之间的技术关系；
（二）参与重点流域内项目（课题）的论证、检查、中期评估和验收；
（三）向水专项办和总体专家组提出重点流域项目（课题）任务或经费调整的建议。
第十一条 水专项任务的承担实行法人负责制，法人单位是项目（课题）实施的责任主体，项目（课题）承担单位对项目（课题）任务完成承担相应责任。项目（课题）参与单位配合承担单位做好项目（课题）相关任务。
第十二条 项目（课题）承担单位基本条件和主要职责
（一）项目（课题）承担单位基本条件
1、在中华人民共和国境内注册，具有独立法人资格的科研院所、高等院校、内资或内资控股企业等企事业单位。
2、科研单位在相关领域应具备良好的科研基础，取得了高水平、有影响力的研究成果，具有较高水平的学术带头人和研究团队。原则上必须主持或参与过国家重大科技项目（如863、973计划、支撑计划等）。企业的注册资金不少于所申请项目（课题）的总经费，具有较强的自主创新能力、相关的工程业绩和工程经验。
对个别未主持或参与过国家重大科技项目，但又具有独特优势的科研单位，应征求水专项总体专家组和相关省级协调领导小组的意见，并报水专项办批准。
3、项目（课题）参与单位之间专业优势互补，与承担单位能进行良好的沟通与合作。
