这一时期知识产权民事诉讼案件有许多特点。一是案件数量持续明显增长，2001年、2002年、2003年受理的一审案件分别同比增长8．62％、17．78％、12．61％，2003年受理的二审收案同比上升44．88％，升幅之大，表明入世和修法对知识产权审判工作已产生深刻影响。二是案件地区分布仍不平衡，主要集中在北京、广东、上海、江苏、浙江、山东等经济文化发达地区，这6省市的案件约占全国的一半。三是知识产权案件中侵权案件比例高，接近80％；高额索赔侵权案件增多，裁判确定的赔偿数额有所提高，特别是适用法定赔偿办法的案件明显增加。四是涉外知识产权案件占有一定比例，2002年和2003年审结的涉外、涉港澳台案件分别占1．98％和2．83％，还出现了不少中国企业状告外国公司或者外资企业的案件。五是案件专业性、技术性增强，事实复杂，证据繁多且认定难度较大，法律关系交叉多，法律适用难度增大，新类型案件多；知识产权授权和维持程序与侵权诉讼程序往往交错进行，合同诉讼与侵权诉讼、权属诉讼相互牵连，中止诉讼较多，审理周期较长。六是当事人多涉及知名企业、科技人员、知识分子、文化名人，案件社会影响大，越来越为媒体、舆论和国际所关注。
人民法院对知识产权的行政司法保护，主要是依法履行对涉及知识产权行政执法的司法复审职能，支持正确的行政执法行为，纠正少数违法行政行为。从2000年至2003年，全国地方法院共受理专利行政案件760件，审结714件。在有单列司法统计的2002年和2003年，全国地方法院共受理商标行政案件93件，审结82件；受理版权行政案件33件，审结30件。整体看，知识产权行政诉讼案件逐年上升，特别引人注目的是，新修改的
专利法和
商标法将所有专利和商标的授权和维持程序改为司法终局裁决以后，以专利复审委员会和商标评审委员会为被告的诉讼案件迅速增长，2003年北京市第一中级人民法院受理专利复审和无效行政案件259件，受理商标评审和撤销行政案件66件。
人民法院加大对知识产权的刑事司法保护。四年共审结知识产权刑事案件1，369件722人。主要集中在侵犯商标犯罪，占全部知识产权犯罪案件的85％；其次是侵犯商业秘密罪，占8．6％；其他知识产权犯罪较少。需要说明的是，目前司法统计并不能准确反映出知识产权刑事司法保护的实际状况，其主要原因是实践中有大量侵犯知识产权犯罪是按照
刑法规定的生产、销售伪劣商品罪和非法经营罪来定罪处罚的，例如涉及著作权的犯罪就多以非法经营罪来处理。总体看，知识产权刑事案件还偏少，但上升较快；共同犯罪、单位犯罪较多；犯罪手段复杂，多属智能型犯罪；连续性犯罪和跨地区犯罪现象比较突出；判处刑期较短，多在三年以下，但并处罚金情况较多。
