第十二条 中央财政专项资金通过财政转移支付方式下拨，财政部下达预算时会签水利部。专项资金拨付到省级财政部门后，省级财政部门应会同水行政主管等部门做好相关工作，落实具体实施项目，按有关规定及时将资金拨付到位。
省级财政部门在收到专项资金后，会同水行政主管部门在二个月内将资金落实到具体项目，并将具体项目清单报财政部、水利部备案。
第十三条 地方财政部门应会同水行政主管部门积极筹措地方配套资金，确保地方配套资金及时、足额到位。国家扶贫开发重点县及新疆维吾尔自治区南疆等地方配套资金全部由省级财政部门会同省级水行政主管部门负责解决，不得将地方配套任务压给县级及县以下。
第十四条 小型病险水库除险加固项目要严格按照《
基本建设财务管理规定》(财建[2002]394号)和《国有建设单位会计制度》(财会字[1995]45号)及补充规定进行管理和核算，并按照规定编报竣工财务决算。
第十五条 地方财政、水行政主管部门应督促项目建设单位做好项目财务管理工作，加强财政资金管理，提高财政资金使用效益。
第五章 建设管理
第十六条 小型病险水库项目严格按规定的基本建设程序进行建设管理，落实“三制”(项目法人责任制、招标投标制、建设监理制)。
(一)各地要严格按照有关规定和程序组建和完善项目建设管理机构，选择符合任职条件的人员担任项目法人代表和技术负责人，严格按照工程项目等级、重要性和技术复杂程度确定建设管理人员的数量、质量。各地可根据实际积极探索集中建设管理模式。
(二)地方财政、水行政主管等部门要加强对招标投标行为的监督管理；维护招标投标秩序。要严格按照有关规定进行招标，规范招标、评标和定标行为，严格控制邀请招标，严禁转包和违法分包。
(三)监理单位必须具备相应的监理资质。要通过公开招标的方式确定监理单位。要选配足够的、符合要求的监理力量承担小型病险水库项目的监理任务。确实难以落实监理单位的，应采取多座小型水库监理业务打捆发包的方式确定监理单位。监理人员必须全部持证上岗。
第十七条 小型病险水库项目原则上应在中央财政专项补助资金下达之日起一年内完工，并在规定的期限内进行竣工验收。
